河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类
生活随笔
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河北大学生命科学学院期末Biopython编程实践。利用Biopython包读取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),将其中FEATURE的类
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計算機高級語言編程實踐報告
2021年1月
基本要求:
1 學習python的Biopython包的使用(Seq,SeqRecord,SeqFeature三個class和SeqIO模塊)。編寫代碼,完成2,3要求。
2 利用Biopython包讀取新冠病毒(id:NC_045512.2)序列(GenBank格式NC_045512.2.gb),將其中FEATURE的類型為CDS的序列片段及其信息截取出來,包裝為SeqRecord對象,再存儲為fasta格式的文件:NC_045512.2_CDS.fasta。內容格式如下所示:
>GeneID:43740578 ORF1ab cds from NC_045512.2 site:join{[265:13468](總結
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