无参转录组和有参转录组分析差异?
生活随笔
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无参转录组和有参转录组分析差异?
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高通量測序技術指一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序,是對傳統測序一次革命性的改變。轉錄組是特定物種、組織或細胞類型轉錄的所有RNA(轉錄本)的集合,包括mRNA和非編碼RNA(Non-coding RNA, 非編碼RNA又包括:tRNA,rRNA,snoRNA,microRNA,piRNA,lncRNA等。通過比較轉錄組或基因表達譜的研究以揭示生物學現象或疾病發生的分子機制是高通量組學研究的一個常用策略。利用高通量測序技術研究轉錄組在全面快速得到基因表達譜變化的同時,還可以通過測定的序列信息 精確地分析轉錄本的cSNP(編碼序列單核苷酸多態性)、可變剪接等序列及結構變異,另外對于檢測低豐度轉錄本和發現新轉錄本具有其獨特的優勢。無參轉錄組指開放性的轉錄組分析——無需參考基因組信息,無需設計探針,不但能檢測已知基因還能夠發現新的轉錄本。有參轉錄組應該是指由參照對象的?
總結
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