看過都說好系列

NGS系列文章包括NGS基礎、轉錄組分析?（Nature重磅綜述|關于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析?（ChIP-seq基本分析流程）、單細胞測序分析?(重磅綜述：三萬字長文讀懂單細胞RNA測序分析的最佳實踐教程 （原理、代碼和評述）)、DNA甲基化分析、重測序分析、GEO數據挖掘（典型醫學設計實驗GEO數據分析 (step-by-step) - Limma差異分析、火山圖、功能富集）等內容。

繼人類基因組計劃（Human Genome Project）之后，人類細胞圖譜計劃（Human Cell Atlas，HCA）直指更遠大的目標：表征一切人體細胞，覆蓋所有組織和器官，描繪健康人體的細胞參考地圖。HCA將提供不同類型細胞組成人體組織的3D圖譜、所有人體系統的通訊方式，以及圖譜變化與健康和疾病的關系。未來，HCA將徹底改善臨床醫生和研究人員對疾病的理解、診斷和治療。

應用一：發現未知的細胞類型

利用單細胞基因組學技術，研究人員發現了罕見細胞類型并命名為“肺離子細胞（pulmonary ionocyte）”。令人意外的是，這類細胞中的CFTR基因表達水平比其他任何細胞類型都高，如果該基因發生突變，就會導致人類囊性纖維化。CFTR對氣管的功能至關重要，幾十年來，研究學者和臨床醫生都知道，它們在纖毛細胞中存在低量表達。但最新數據卻告訴我們，CFTR竟然一直“悄悄地”在特定類型的細胞中大量表達，這將改變了我們對囊性纖維化和哮喘等肺病的認識。

應用二：確定細胞分化的順序

利用單細胞基因組學技術，科研人員追蹤了斑馬魚發育過程中心臟、神經和血細胞的發育過程，包含了約4萬個單細胞分析的結果，完整重建了斑馬魚配胚胎發育過程中單個細胞的發育軌跡，在發育生物學中具有里程碑意義。

應用三：識別細胞使用的程序

利用單細胞基因組學技術，研究人員鑒定出惡性腫瘤細胞中存在的一種免疫抵抗性程序，多種免疫抵抗性機制在這種免疫抵抗性程序中受到共同調節，而且這種免疫抵抗性程序可預測黑色素瘤患者對免疫治療作出的反應，此外，CDK4/6抑制劑可抑制這種免疫抵抗性程序，從而可能讓黑色素瘤對免疫治療變得敏感。

應用四：了解復雜疾病的發病機理并指導疾病治療

利用單細胞基因組學技術，研究人員揭示了特定風險基因所對應的細胞種類和信號通路。這項工作不僅鑒定出在潰瘍性結腸炎這個疾病模型中一些已知的風險基因在不同細胞類型和信號通路的分布，同時為今后利用單細胞基因組學技術去尋找疾病的成因以及治療方法提供了一個很好的技術框架。

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細胞作為生命活動最為基本的單元，是所有生命活動的基石。自從虎克發明顯微鏡以來，生物學家在各種顯微鏡-從普通光學顯微鏡到最近的超分辨顯微鏡等條件下工作了已經近180年，但對細胞的認知仍一知半解。

近年來，隨著單細胞分離技術和高通量測序技術的不斷發展，已經可以在單細胞水平上鑒定DAN突變、RNA轉錄物、蛋白質、染色質開放性和其它細胞成分等，為系統解碼單細胞功能圖譜以及調控網絡帶來了機遇。

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總結

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