2019年9月13，往年這個時候的大學(xué)，‘學(xué)習(xí)’氣氛正灼，考研人月下抱書疾行，披星奔赴自習(xí)室。而農(nóng)歷八月十五與平時不同的是，會收到學(xué)院給的冬瓜餡（劃掉）果仁餡月餅，聊以寄思。今日又逢仲秋時分，人的地點或狀態(tài)在變，不變的始終是中秋月夜的這份月餅。

而就在近日，國產(chǎn)C919干線客機(jī)第四架測試機(jī)，編號B-001E從中國商飛試飛中心東營基地起飛，在完成導(dǎo)航LOC全向性科目試飛過程中，用國航獨有的浪漫給大眾贈送了一份“梅花月餅”。這份由試飛航跡呈現(xiàn)的梅花月餅是在1000米低空手動飛出來的，而為了提高效率，機(jī)組選組一次性飛出8個方向，難度可見一般，最后的效果也不可謂不匠心獨運。

圖片來源：中國商飛

國航人可以手動在地圖上畫各種航線，生信人也可以用R語言手動在地圖上展示一份專屬路線圖。

REmap

REmap正可以幫助我們實現(xiàn)，它是基于Echarts的一個R包，用Echarts封包,地圖繪制使用的是SVG圖形，可以獲取經(jīng)緯度、制作個性化地圖時可以繪制路線，更新之后也加上了中國地圖的熱力圖，功能探索起來有些樂趣，不過今天我們還是只需要簡單的路線圖。

首先裝包，我是在它的github主頁直接下載源文件安裝的，下面的方法測試過也能成功。

library(devtools) install_github('lchiffon/REmap') library(REmap)

路線圖的繪制主要是用函數(shù)remap

remap(mapdata, title = "", subtitle = "", theme =get_theme("Dark"))

這個函數(shù)的參數(shù)理解很簡單，mapdata是一個數(shù)據(jù)框,第一列為出發(fā)點,第二列為目的地，title標(biāo)題，subtitle?副標(biāo)題，theme?是生成地圖的顏色。

舉個例子

下面以辦公室成員回家路線作為示例

origin = rep("北京",5) # 5是目的地個數(shù),length(destination) destination = c("山西","山東","河南","黑龍江"，"湖北") dat = data.frame(origin,destination) out = remap(dat,title = "",subtitle = "",theme = get_theme("Bright")) plot(out)

出來的是一個交互式的html（推薦使用chrome或者火狐瀏覽器），有時候因為設(shè)備的不同，定位也會有問題，需要提供百度API，這個時候可以向百度注冊申請（http://lbsyun.baidu.com/apiconsole/key）。得到API后運行options(remap.ak = “API碼”)，之后即可定位成功。

主題還可自由定制，顏色則是根據(jù)自己喜好

out = remap(dat,title = " ",theme = get_theme("None",lineColor = "skyblue",backgroundColor = "#FFC1C1",titleColor ="#fff",borderColor = "rgba(100,149,237,1)", regionColor = "#009688")) plot(out)

對REmap感興趣的話可以去github主頁（https://github.com/Lchiffon/REmap）探索分享。

REmap是基于Echarts的一個包，Echarts是一個強(qiáng)大的交互式可視化瀏覽器上表格的庫，我們的學(xué)員分布圖正是基于Echarts繪制，星星點點的亮光聚在一起也總是好看 (可惜有美國、澳大利亞和新西蘭來參加培訓(xùn)的朋友沒有辦法畫出來，以后更新成世界地圖)。

《生信寶典》聯(lián)合《宏基因組》微信公眾號于2017年11月開始第一期生物信息研討班，至今已27期。把之前需要學(xué)習(xí)1-3年的知識系統(tǒng)梳理，通過3天集訓(xùn)+視頻快速掌握。現(xiàn)已線下服務(wù)老師總計954人（1188人次，有數(shù)十位老師參加過3門以上不同課程），騰訊和網(wǎng)易課堂線上服務(wù)老師總計4200+人次。他們來自全國各地，有高等院校的教授、副教授、海外科研者，也有不少是醫(yī)藥領(lǐng)域、科技公司的領(lǐng)導(dǎo)和從業(yè)者，以及廣大活躍在一線的本科生、碩士生和博士生。

在促進(jìn)跨界交流的同時，也體現(xiàn)了生物信息學(xué)的發(fā)展速度和應(yīng)用的廣泛性，以及各領(lǐng)域相關(guān)人員對生信分析技能的求知欲。這也是易生信開辦培訓(xùn)的原因，希望通過主講老師十年的科研實戰(zhàn)經(jīng)驗，為大家提供一條走進(jìn)生信大門的捷徑。

非常不完全統(tǒng)計，參加第一期課程的朋友的一作Nature在半年前上線了，參加第三期課程的朋友通訊作者的Plant Physiology也于半年前發(fā)表，參加第四期課程的朋友做起了菌群檢測的公司，第五期課程的朋友Cell Research走起了，第七期培訓(xùn)我們用了參會學(xué)員的文章作為示例（對我們來講這位學(xué)員也是我們的老師），更多的朋友或者發(fā)表SCI順利畢業(yè)，或者提升為教授或副教授了，或者評為優(yōu)青、青千等，都得到了自己的技能提升。我們的講師也發(fā)表了Science, NBT, Nature Communication, Nucleic Acids Research等。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的那天空飘过的梅花月饼，是今年中秋最好的礼物的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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