生物信息學習的正確姿勢

NGS系列文章包括NGS基礎、高顏值在線繪圖和分析、轉錄組分析?（Nature重磅綜述|關于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析?（ChIP-seq基本分析流程）、單細胞測序分析?(重磅綜述：三萬字長文讀懂單細胞RNA測序分析的最佳實踐教程)、DNA甲基化分析、重測序分析、GEO數據挖掘（典型醫學設計實驗GEO數據分析 (step-by-step)）、批次效應處理等內容。

撰文｜nagashi

編輯｜王聰

排版｜水成文

人們常說：錢不是萬能的。但是，錢卻能在很大程度上反映一個人的能力。會掙錢的人往往在智商、情商、決策力或行動力上優于常人。

在生命科學快速發展的今天，人們也越來越清楚地認識到智商和情商等在很大程度上是受到基因影響的。

那么，一個人的收入水平，或者說是掙錢的能力，是否也會與基因相關呢？

2019年12月，愛丁堡大學 W. David Hill 團隊在國際頂尖學術期刊 Nature ?雜志子刊 Nature Communications 雜志上發表了題為：Genome-wide analysis identifies molecular systems and 149 genetic loci associated with income（全基因組分析確定了與收入相關的分子系統和149個遺傳位點）的研究論文。

在該論文中，研究者使用全基因組關聯分析（GWAS）對來自英國生物銀行的286301個人進行家庭收入的基因關聯性分析。研究人員確定了30個獨立的全基因組顯著位點，其中29個在以前的工作中未見報道，還發現了另外120個基因座與收入相關。

此外，研究還發現與收入差異相關的基因主要是那些以前發現的與智力相關的基因，而智力是導致收入差異的重要原因之一。

社會經濟背景優越的人平均壽命更長，精神和身體狀態也比來自貧困環境的人更好。了解社會經濟地位（SEP）與健康之間關聯的原因，有助于將社會的健康和福利差距降至最低。

SEP與健康之間的聯系通常被認為是由環境因素造成的，包括但不限于獲取資源、暴露于有害或壓力環境、吸煙、飲食不良、飲酒過量、缺乏體育鍛煉等行為。最新研究表明，全基因組關聯研究（GWAS）可以獲取健康和SEP之間的共同遺傳關聯。潛在的多向效應在SEP變量（如完成教育年限、家庭收入和社會剝奪）與生理和心理健康特征（包括壽命）之間的遺傳相關性中得到了強調。

與兩種SEP表型相關的位點（教育和家庭收入）已通過GWAS得到確認，但與其他復雜性狀（如身高）一致，這些位點加在一起僅占相關性狀總遺傳力（遺傳力=基因型方差/（基因型方差+環境方差），即基因對性狀的影響比例）的一小部分。

就家庭收入而言，對來自英國的96900個樣本的分析發現，由普通單核苷酸多態性（SNPs）標記的加性遺傳方差在家庭收入差異約占11% (SE = 0.7%)。在該研究中，兩個位點具有全基因組的顯著性，但它們共同占總SNP遺傳力不足0.005%。

在本論文中，研究者使用英國生物銀行的數據集來檢查當代英國樣本中家庭收入的基因關聯性（n = 286301）。研究人員確定了30個獨立的全基因組顯著位點，其中29個在以前的工作中未見報道。研究者使用一種利用遺傳相關性狀的遺傳力的方法，對GWAS（MTAG）進行多性狀分析，發現另外120個基因座與收入相關。

他們還發現神經發生和突觸的成分與收入有關。此外，研究者還將多種大腦皮質組織類型之間的轉錄差異以及GABA能和5-羥色胺能的神經傳遞與收入差異聯系起來。

通過與eQTL和染色質互作分析，研究人員將上述基因位點縮小至24個基因，其中18個是與智力相關的基因，表明智力是導致收入差異的重要原因。

研究者將收入遺傳相關性與用另一種SEP遺傳相關性進行了比較，以表明與收入相關的遺傳變異比與教育相關的遺傳變異對身心健康的影響更大。

收入水平可以在一定程度上反映個人能力及身心素質。而這項研究表明，基因與收入水平存在著顯著的相關性，體現在基因可以影響人的智力水平和性格特征（神經特性）等。

美國科學院院士，基因大神 George Church 宣布正在開發一個約會App，讓人們通過基因來相互匹配，希望通過基因匹配，避免攜帶共同隱性基因突變的人結合而產生攜帶遺傳病的后代。

論文鏈接：

https://doi.org/10.1038/s41467-019-13585-5

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的Nature子刊：是穷是富与基因有关？大数据分析发现149个与收入相关基因位点的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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