roc曲线怎么绘制_利用ROC曲线寻找最佳cutoff值(连续型变量组成的riskscore)
生活随笔
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roc曲线怎么绘制_利用ROC曲线寻找最佳cutoff值(连续型变量组成的riskscore)
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我們在看臨床模型類文獻(xiàn)的時(shí)候,雖然常看到用 X-tile 尋找變量的最佳cutoff值,但是有時(shí)候也會看到有的文章是用ROC曲線來尋找最佳cutoff值的,下面我們一探究竟吧,注本期所用的連續(xù)型變量為riskscore,而構(gòu)建riskscore的基因表達(dá)量也是連續(xù)型變量。
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)knitr::opts_chunk$set(warning = F)knitr::opts_chunk$set(message = F)載入必要的R包
rm(list=ls())library(tibble)library(dplyr)library(tidyr)library(survivalROC)載入數(shù)據(jù)
clinicalhead(clinical)[1:5,1:5]## 將第一列變成行名clinical % column_to_rownames("sample")處理時(shí)間
### 將生存時(shí)間轉(zhuǎn)化成年(之前已經(jīng)為年了,所以除以1。如果為天則除以365。月則除以12) clinical$futime=clinical$futime/1 predict_time1=3predict_time2=5總結(jié)
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