使用python包scanpy读取单细胞h5ad文件
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
使用python包scanpy读取单细胞h5ad文件
小編覺得挺不錯的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個參考.
import scanpy as sc
annData = sc.read_h5ad(filePath)
print(annData.to_df()) #這里顯示的就是單細胞數(shù)據的pandas.DataFrame類型了
#其中annData.var里面的是細胞,annData.var里面的是基因
總結
以上是生活随笔為你收集整理的使用python包scanpy读取单细胞h5ad文件的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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