lammps建模時(shí)，我們使用create_atoms創(chuàng)建原子，有些情況下，需要?jiǎng)h除一些原子，用到的命令為：delete_atoms。
delete_atoms語法：

delete_atoms style args keyword value ...

下面介紹delete_atoms常見的用法
1.刪除組內(nèi)或區(qū)域內(nèi)原子
整組或者整個(gè)區(qū)域刪除原子，直接使用group或者region關(guān)鍵字即可，刪除原子后原子ID已經(jīng)不連續(xù)，使用compress yes可對(duì)ID序號(hào)進(jìn)行壓縮，也就是重新排序，產(chǎn)生連續(xù)的原子ID。

#刪除edge組內(nèi)所有原子 delete_atoms group edge #刪除sphere區(qū)域內(nèi)所有原子，并且不壓縮ID delete_atoms region sphere compress no

2. 刪除重疊原子
在不同區(qū)域內(nèi)填充原子，有可能會(huì)造成兩區(qū)域邊界部分原子重疊，產(chǎn)生重疊的原子之間受力過大容易飛出box，出現(xiàn)“l(fā)ost atoms”錯(cuò)誤。
因此，在建模時(shí)可刪除重疊原子，用的命令為：
delete_atoms overlap args = cutoff group1-ID group2-ID
group1-ID、group2-ID為兩個(gè)原子組，cutoff確定原子間距，間距在cutoff內(nèi)并且分別處于兩個(gè)組內(nèi)的原子之一（group1-ID組）會(huì)被刪除。
如：

delete_atoms overlap 0.3 group1 group2

3. 隨機(jī)刪除原子
按照一定比例隨機(jī)刪除原子，比如隨機(jī)產(chǎn)生空位，語法為：
delete_atoms porosity args = region-ID fraction seed
fraction為刪除原子比例，seed為隨機(jī)數(shù)種子。

delete_atoms porosity cube 0.1 482793

4. 刪除分子
分子含有多個(gè)原子，如果僅刪除一個(gè)原子，如H2O僅刪除一個(gè)H或者一個(gè)O原子，在模擬的時(shí)候可能會(huì)報(bào)錯(cuò)。
這時(shí)候就需要?jiǎng)h除整個(gè)H2O分子，加上關(guān)鍵字mol即可。

delete_atoms overlap 0.5 Water Cu mol yes

以上為delete_atoms的主要用法，更高級(jí)的使用說明請(qǐng)查詢官網(wǎng)手冊(cè)。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的lammps教程：delete_atoms 命令详解的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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