解螺旋公眾號·陪伴你科研的第1869天

繼續學習如何不做實驗發文章

RNA結合蛋白是(RNA binding protein，RBP)細胞中一類可以識別特殊的RNA結合域與RNA互作，并參與RNA剪切、轉運、序列編輯、胞內定位及翻譯控制等多種轉錄后的調控過程中。

既然RBP功能這么重要，那么有什么辦法研究RBP與RNA相互作用呢？還是StarBase這個神器(http://starbase.sysu.edu.cn )

這個神器可以研究RBP與多種RNA的相互作用，包括mRNA、lncRNA、pseudogene、sncRNA、circRNA。點擊選擇你感興趣的項目，即可進入數據展示和篩選界面。

工具左邊的欄目的選項和之前文章介紹(往期文章見文章底部)大同小異，主要設置RNA結合蛋白RBP和Target Gene，其他的設置主要是設置篩選的范圍和證據的嚴格度。

右邊的顯示欄解釋如下圖，用戶可以在上圖里選擇靶基因，也可以在下面的“Search”

“HepG2 (log2FC)”和“K562 (log2FC)”為在這兩種細胞里，敲降RBP時gene的表達變化。點擊“Pan-Cancer”下的數字后，網頁會跳轉到顯示在TCGA中的結果。

點擊“ClusterNum”，跳出結果顯示框解釋如下：

點擊“ClipExpNum”

點擊“Accesion”可查看證據數據在GEO的數據來源，也可以根據“Reference”查看證據的原始文獻。

RBP與Target的相互作用部分的操作，只有RBP-CircRNA的結果顯示不一樣，結果界面相對少一點，其余部分都是一致的。

祝大家能有滿意的實驗結果！

—END—

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總結

以上是生活随笔為你收集整理的console.log()不显示结果_RNA结合蛋白与RNA的缠绵故事，教你不做实验发文章的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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