命令行：

~/sratoolkit/sratoolkit.2.3.2/bin/fastq-dump --split-spot --gzip xxxx.sra

報(bào)錯(cuò)信息:

fastq-dump.2.3.2 err: name not found while resolving tree within virtual file system module - failed to open 'xxxx.sra'

解決方法：

找不到xxx.sra，就給它全路徑就可以了

the problem happens when you use a local path for the SRA file. Try using the absolute path! fastq-dump /data/etc/SRR00000.sra should do the trick

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http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=29447

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轉(zhuǎn)載于:https://www.cnblogs.com/emanlee/p/3350057.html

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的fastq-dump 报错 解决方案的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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