等位基因共占法是怎样的一种方法?
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等位基因共占法是怎样的一种方法?
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補充一點:在受累同胞對(Affected sib pair, ASP)分析中,當標記位點與疾病無連鎖時,雙親的標記位點等位基因隨機分配給子代;若存在連鎖,則受累同胞間共有等位基因機率將高于連鎖時的預期值。家系成員(APM)分析是ASP的延伸,通過觀察家系內所有患病成員標記位點等位基因的共有情況,來提高每個家系的信息量。原則上,若具備雙親樣本材料,可據此判定受累同胞的相同等位基因片段是否同源,即傳遞一致性(identical-by-descent, IBD)分析;若無雙親資料,則只能通過同胞間等位基因比較來推測其是否共有,即狀態一致性(identical-by-state, IBS)分析。若雙親均為純合子以致判斷困難者,可經統計處理用最大擬然實驗估測出最可能的傳遞情況。
等位基因共占法是基于觀察受累同胞或家系成員間標記位點等位基因的共占情況,即來源于同一祖先的致病基因由受累的親屬共占的機率大于隨機分布的機率,包括受累同胞對(Affected sib pair, ASP)分析及家系成員(APM)分析。該法優點是:①不受遺傳模式等遺傳參數影響,為非參數分析法;②對系譜材料要求低,只需一代或二代的家系內患病成員資料,而不需非患病成員資料;③可進行定量性狀研究;④ 可研究兩個不相連鎖位點對疾病的聯合作用,以解決復雜病易感基因間的相互關系;⑤對遺傳異質性容許度大;⑥在候選基因研究中可應用間距較遠(~20cM)的標記,故特別適合多基因遺傳病及參數情況多數未明的復雜病研究。缺點在于:①對連鎖的判別效能弱于家系連鎖分析,不能確定連鎖程度;②檢出力低于相關分析;③若家系中雙親均為患者的機率較高時,因易感基因可由雙親傳遞給子代,會影響分析正確性。
等位基因共占法是基于觀察受累同胞或家系成員間標記位點等位基因的共占情況,即來源于同一祖先的致病基因由受累的親屬共占的機率大于隨機分布的機率,包括受累同胞對(Affected sib pair, ASP)分析及家系成員(APM)分析。該法優點是:①不受遺傳模式等遺傳參數影響,為非參數分析法;②對系譜材料要求低,只需一代或二代的家系內患病成員資料,而不需非患病成員資料;③可進行定量性狀研究;④ 可研究兩個不相連鎖位點對疾病的聯合作用,以解決復雜病易感基因間的相互關系;⑤對遺傳異質性容許度大;⑥在候選基因研究中可應用間距較遠(~20cM)的標記,故特別適合多基因遺傳病及參數情況多數未明的復雜病研究。缺點在于:①對連鎖的判別效能弱于家系連鎖分析,不能確定連鎖程度;②檢出力低于相關分析;③若家系中雙親均為患者的機率較高時,因易感基因可由雙親傳遞給子代,會影響分析正確性。
總結
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