量子可视化技术让我们深入了解光合作用
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“很難相信相干圖是如此簡單,” 伊利諾伊大學化學教授兼項目負責人Nancy Makri說。“當將非直覺的量子現象作為光合作用等復雜過程的一部分來處理時,解釋理論計算可能是一個相當大的挑戰。但是相干圖會在快照中告訴你你需要知道的一切。”
在 發表在《物理化學快報》上的一項研究中,Makri 的研究小組應用相干圖 以一種新的方式分析 早期對光合細菌的計算機模擬。研究人員研究了“收獲”陽光、吸收陽光并將其能量轉移到處理二氧化碳和水的化學反應部位的分子復合物。相干圖不僅清楚地顯示了能量是如何轉移到反應部位的,而且還對這種轉移給出了清晰的量子解釋。
Makri 解釋說,相干圖是縮減密度矩陣的圖示,密度矩陣是一個數學對象,包含有關系統量子行為的所有信息。“即使對于中等規模的系統,降低的密度矩陣也會變得相當大,而且它的所有組件都是相互關聯的,”她說。“要分析的信息實在是太多了。不過,有了相干圖,一眼就能從圖片中彈出大量信息。”
根據 Makri 的說法,這些信息使研究人員能夠“非常透明地”識別細菌光收集復合物中的能量轉移途徑。該復合物包含分子的外環和內環。外環吸收陽光,內環包含化學反應部位。Makri 的小組表明,這兩個環是通過分子中原子的運動連接起來的,相干圖清楚地表明這些運動將能量從外環集中到內環。
“展望未來,我相信相干圖將成為基于量子力學的理論分析的寶貴工具,”Makri 說。“就在這項研究中,他們對光合作用機制給出了重要見解,這是生物學的一大奧秘。”
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總結
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