文献阅读方法 如何阅读英文文献 - 施一公(转)
附:
如何看懂英文文獻(xiàn)?(好) 看需求,分層次
如何總結(jié)和整理學(xué)術(shù)文獻(xiàn)??Mendeley & Everything
如何在pdf文獻(xiàn)上做筆記?福晰閱讀器
自己感悟:
一篇專業(yè)文獻(xiàn)通常會(huì)有幾頁(yè)到幾十頁(yè)不等,讀文獻(xiàn)是一個(gè)過于籠統(tǒng)的概念。
讀文獻(xiàn)必須要分為幾個(gè)不同的程度(需求):
1.讀著玩,了解領(lǐng)域動(dòng)態(tài)。 那你看看摘要就好了,讀懂標(biāo)題,知道本文的核心結(jié)論就好。具體要求見知乎文章。
2.準(zhǔn)備入一行,擴(kuò)充知識(shí)面。重點(diǎn)讀引言,看圖表結(jié)果,大致了解本文的邏輯推理路線。
3.準(zhǔn)備借鑒此文造自己的文章。這就是最深層次的閱讀了,必須要理解本文的設(shè)計(jì)理念,此時(shí)討論就尤為重要。
幾不要:
1.不要高亮不認(rèn)識(shí)的詞,沒意義,只能高亮文章的邏輯核心詞匯和語(yǔ)句。
2.不要一開始就通讀,這樣你很快就讀不下去;正確的做法是由總到細(xì),由淺及深,分步閱讀。
3.不要讀完就不管了,在沒有自我總結(jié)之前,知識(shí)是不屬于你的!!!
4.不要以為文獻(xiàn)讀一遍就夠了,理解認(rèn)知是一個(gè)螺旋循環(huán)上升的過程。
建議初學(xué)者的讀文獻(xiàn)步驟:
1.先粗略讀懂文章題目、摘要和結(jié)論
雖然是粗略,但是必須要完全讀透,字義,語(yǔ)法結(jié)構(gòu)。之所以說是粗略,是因?yàn)檫@一遍你肯定不會(huì)理解很深,因?yàn)槟悴恢辣疚牡挠蓙?#xff0c;以及本文解決的問題,以及本文的設(shè)計(jì)思路。
Abstract往往包含這么幾個(gè)最基本也是最重要的元素
1.這篇文章研究了什么(為什么研究這個(gè))
2.采用了什么方法(為什么采用這個(gè)方法)
3.得到了什么結(jié)果(結(jié)果好在哪里)
通過摘要,你可以得到的信息有:
1.這篇文章與我的研究?jī)?nèi)容是否相關(guān)?
2.采用的方法是否新穎,我是否感興趣?
3.他的結(jié)果,是我想要的么?
以上三個(gè)問題,可以變化你閱讀論文心中所帶的問題,即:
1.他是如何把這種方法運(yùn)用到這類問題中的?(學(xué)習(xí))
2.它的結(jié)果完美么?是否是充分必要的?保守性強(qiáng)不強(qiáng)?有沒有可以改進(jìn)的地方?(總結(jié)+反思)
所以,閱讀論文的Abstract,實(shí)際是你為閱讀論文所做的最重要的準(zhǔn)備工作,帶著問題去讀論文才最有效率,萬萬不可跳過Abstract。
每次讀完文獻(xiàn)(不管是細(xì)讀還是粗讀),合上文獻(xiàn)后,想想看,文章最重要的take home message是什么,如果不知道,就從abstract, conclusion里找,并且從discuss里最好確認(rèn)一下。這樣一來,一篇文章就過關(guān)了。take home message其實(shí)都不會(huì)很多,基本上是一些concepts,如果你發(fā)現(xiàn)你需要記得很多,那往往是沒有讀到重點(diǎn)。
2.開始抓本文的框架,讀引言,看結(jié)果,明確作者是如何一步一步論證的。
此時(shí)不必過于深究細(xì)節(jié),把握整體即可。
明確最重要的一點(diǎn),如果你連本文的框架都抓不住,那你肯定不會(huì)理解細(xì)節(jié)。
Introduction部分包含的信息有:
1.此問題的由來(歷史)
2.此問題在全世界內(nèi)的研究進(jìn)展(現(xiàn)狀)
3.引申出作者的研究動(dòng)機(jī)
此時(shí)你必須要能回答出幾個(gè)問題才算真正抓住了本文的核心:文章的引言、結(jié)果和結(jié)論是如何將摘要詳細(xì)展開的。
3.仔細(xì)讀文章的每一個(gè)圖表,反復(fù)的深入了解文章使用的技術(shù)手段,了解作者通過什么手段解決了什么問題。(實(shí)現(xiàn)層面)
Main results讀起來會(huì)有這樣的感覺:讀到一半,居然忘了自己在看什么,忘了自己為什么要讀這篇文章,忘了他到底在證明些個(gè)什么東西,還有就是每個(gè)環(huán)節(jié)都懂了,最后連在一起還是不懂...那么說明你的大腦已經(jīng)跟不上偉人的腳步了,你需要一桿筆和一張紙。
讀一點(diǎn),就在紙上做一點(diǎn)筆記,有問題標(biāo)記出來,讀完一遍之后回頭看這些問題,或去查資料,或去請(qǐng)教老師,然后再讀一遍論文,一篇好的論文,值得你去來回讀個(gè)至少五遍的。
4.從文章作者的角度來審視這篇論文,如果是我,我會(huì)怎么來設(shè)計(jì)這個(gè)論文,與真正作者之間有哪些不一樣的想法。
什么時(shí)候你看著nature級(jí)別的文章時(shí)都能提出自己的想法,那你離發(fā)nature也就不遠(yuǎn)了。
以上僅為我的一家之言,僅供參考。(By xin49)
從小到大,我感性思維多一些,不善于讀書。85至89年在清華生物系讀本科期間,從未讀過任何一種英文專業(yè)期刊。我受到的與英文閱讀相關(guān)的訓(xùn)練一共只有兩個(gè)。一是我在1986年暑假期間選修的時(shí)任系主任的蒲慕明老師開設(shè)的《生物英語(yǔ)》系列講座,隱隱約約記得蒲先生讓我們閱讀一些諸如DNA雙螺旋發(fā)現(xiàn)之類的科普性英文文章,很有意思。但時(shí)間較短,暑假過后也沒有養(yǎng)成讀英文文章的習(xí)慣。二是《生物化學(xué)》這門課。與現(xiàn)在的清華生命學(xué)院形成鮮明對(duì)比,我上大學(xué)期間的所有基礎(chǔ)課和專業(yè)課都是采用中文教材、中文講課,只有鄭昌學(xué)老師講授的《生物化學(xué)》采用了Lehninger的《Principles of Biochemistry》,而且鄭老師要求我們每個(gè)學(xué)生每次課后閱讀10-20頁(yè)教材。我們同學(xué)大多感覺到專業(yè)英文閱讀有所提高。
1990年4月至7月初,我在依阿華州Ames小鎮(zhèn)的Iowa State University度過了初到美國(guó)的前三個(gè)月,其中大部分時(shí)間在Herbert Fromm教授的實(shí)驗(yàn)室做輪轉(zhuǎn)(rotation),跟隨劉峰和董群夫妻兩人做研究(劉峰現(xiàn)在University of Texas Health Science Center做教授)。當(dāng)時(shí)感覺最困難的就是讀專業(yè)論文。有一次,Fromm教授要求我在組會(huì)上講解一篇《Journal of Biological Chemistry》的文章,我提前兩天開始閱讀,第一遍花了足足六個(gè)小時(shí),許多生詞只能依靠英漢詞典,文章中的有些關(guān)鍵內(nèi)容還沒有完全讀懂,當(dāng)時(shí)的感覺是JBC的文章怎么這么長(zhǎng)、這么難懂?!真有點(diǎn)苦不堪言。為了能給Fromm教授和師兄師姐留下好印象,第二天又花了好幾個(gè)小時(shí)讀第二遍,還做了總結(jié)。第三天我在組會(huì)上的表現(xiàn)總算沒有給清華丟臉。但是,前前后后,真搞不清楚自己為了這一篇文章到底花了多少時(shí)間!
90年7月我轉(zhuǎn)學(xué)到約翰霍普金斯大學(xué)以后,與本科來自北大的虞一華同在IPMB program。虞一華大我一歲,來巴爾地摩之前已經(jīng)在夏威夷大學(xué)讀了一年的研究生,對(duì)于科研論文的閱讀比我強(qiáng)多了。他常常在IPMB的辦公室里拿著《科學(xué)》和《自然》周刊津津有味地閱讀,看得我很眼饞,也不理解其中那些枯燥的文章有什么意思。他告訴我:他在讀很有意思的科學(xué)新聞??茖W(xué)新聞能有什么意思?虞一華給我講了好幾個(gè)故事:洛克菲勒大學(xué)校長(zhǎng)諾貝爾獎(jiǎng)得主David Baltimore如何深陷泥潭、人類基因組測(cè)序如何爭(zhēng)辯激烈、HIV病毒究竟是誰(shuí)發(fā)現(xiàn)的,等等。我還真沒有想到學(xué)術(shù)期刊上會(huì)有這么多我也應(yīng)該看得懂的內(nèi)容!從那時(shí)起,每一期新的《科學(xué)》和《自然》一到,我也開始嘗試著閱讀里面的新聞和研究進(jìn)展介紹,這些內(nèi)容往往出現(xiàn)在“News & Comment”“Research News”“News & Views”“Perspectives”等欄目,文筆平實(shí),相對(duì)于專業(yè)的科研論文很容易讀懂。有時(shí),我還把讀到的科研新聞講給我的同事朋友們聽,而同事的提問和互動(dòng)對(duì)我又是更好的鼓勵(lì)。除了《科學(xué)》和《自然》,我也常常翻看《科學(xué)美國(guó)人》(“Scientific American”)。
與《細(xì)胞》(Cell)、《生物化學(xué)期刊》(JBC)等非常專業(yè)的期刊不同,《科學(xué)》和《自然》里面有相當(dāng)一部分內(nèi)容是用來做科普教育的?!犊茖W(xué)》周刊的“Perspectives”和《自然》周刊的“News & Views”欄目都是對(duì)重要科學(xué)論文的深入淺出的介紹,一般1-3頁(yè),讀起來比較通俗易懂,較易入門。讀完這些文章后,再讀原始的科學(xué)論文,感覺好多了!而且可以把自己的體會(huì)與專家的分析比較一下,找找差距,有時(shí)甚至也能找回來一點(diǎn)自信!
從1998年在普林斯頓大學(xué)任職到現(xiàn)在清華大學(xué)做教授,我總是告訴自己實(shí)驗(yàn)室的所有年輕人(包括本科生、碩士生、博士生、博士后)下面這幾點(diǎn)讀科研論文的體會(huì),也希望我的學(xué)生跟我學(xué):
1.請(qǐng)每位學(xué)生每周關(guān)注《科學(xué)》和《自然》。(生命科學(xué)界的學(xué)生還應(yīng)該留心《細(xì)胞》)。如果時(shí)間有限,每周花一個(gè)小時(shí)讀讀這兩種周刊里的文章標(biāo)題以及與自己研究領(lǐng)域相關(guān)的科研論文的abstract,即可!這樣做可以保證一個(gè)學(xué)生基本上能夠跟蹤本領(lǐng)域最重要的發(fā)現(xiàn)和進(jìn)展,同時(shí)開闊視野,大概知道其它領(lǐng)域的動(dòng)態(tài)。
2.在時(shí)間充足的情況下,可以細(xì)讀《科學(xué)》和《自然》里的新聞及科研論文。如果該科研論文有“News & Views”或“Perspectives”來介紹,請(qǐng)先讀這些文章,這類導(dǎo)讀的文章會(huì)提煉問題,就好比是老師事先給學(xué)生講解一番論文的來龍去脈,對(duì)學(xué)生閱讀原始論文有很大幫助。
3.在讀具體的科研論文時(shí),最重要的是了解文章的主線邏輯。文章中的所有Figures都是按照這個(gè)主線邏輯展開描述的。所以,我一般先讀“introduction”部分,然后很快地看一遍Figures。大概知道這條主線之后,才一字一句地去讀“results”和“discussion”。
4.當(dāng)遇到一些實(shí)驗(yàn)或結(jié)果分析很晦澀難懂時(shí),不必花太多時(shí)間深究,而力求一氣把文章讀完。也許你的問題在后面的內(nèi)容中自然就有解答。這與聽學(xué)術(shù)講座非常相似!你如果想每個(gè)細(xì)節(jié)都聽懂,留心每一個(gè)技術(shù)細(xì)節(jié),那你聽學(xué)術(shù)講座不僅會(huì)很累,而且也許會(huì)為了深究一個(gè)小技術(shù)環(huán)節(jié)而影響了對(duì)整個(gè)講座邏輯推理及核心結(jié)論的理解。
5.對(duì)個(gè)別重要的文章和自己領(lǐng)域內(nèi)的科研論文,應(yīng)該精讀。對(duì)與自己課題相關(guān)的每一篇論文則必須字斟句酌地讀。這些論文,不僅要完全讀懂,理解每一個(gè)實(shí)驗(yàn)的細(xì)節(jié)、分析、結(jié)論,還必須聯(lián)想到這些實(shí)驗(yàn)和結(jié)論對(duì)自己的課題的影響和啟發(fā),提出自己的觀點(diǎn)。
6.科學(xué)論文的閱讀水平是循序漸進(jìn)的。每個(gè)人開始都會(huì)很吃力,所以你有這種感覺不要?dú)怵H。堅(jiān)持很重要,你一定會(huì)漸入佳境。當(dāng)你有問題時(shí)或有絕妙分析時(shí),應(yīng)該與師兄師姐或找導(dǎo)師討論。
7.科研訓(xùn)練的一個(gè)重要組成部分就是科研論文的閱讀。每一個(gè)博士生必須經(jīng)過嚴(yán)格的科研論文閱讀的訓(xùn)練。除了你自己的習(xí)慣性閱讀外,你應(yīng)該在研究生階段選修以閱讀分析專業(yè)文獻(xiàn)為主的一至兩門課,在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)也要有定期的科研論文討論(Journal Club)。如果你的實(shí)驗(yàn)室還沒有這種討論,你們學(xué)生可以自發(fā)地組織起來。
8.前面幾條都是討論如何提高科研論文的閱讀能力,但是一旦入了門,就要學(xué)會(huì)critical reading。不要迷信已發(fā)表的論文,哪怕是發(fā)表在非常好的期刊上。要時(shí)刻提醒自己:該論文邏輯是否嚴(yán)謹(jǐn),數(shù)據(jù)是否可靠,實(shí)驗(yàn)證據(jù)是否支持結(jié)論,你是否能想出更好的實(shí)驗(yàn),你是否可以在此論文的基礎(chǔ)上提出新的重要問題?等等。
天外有天,讀科研論文是一件很簡(jiǎn)單、但也很深?yuàn)W的事情。一般的學(xué)生常常滿足于讀懂、讀透一篇好的論文,優(yōu)秀的學(xué)生則會(huì)舉一反三、通過查找references縱深了解整個(gè)領(lǐng)域的歷史、現(xiàn)狀,并展望該領(lǐng)域未來的可能進(jìn)展。
我從1990年對(duì)學(xué)術(shù)論文一竅不通到96年博士后期間的得心應(yīng)手,還常常幫助同事分析,自以為水平了得。但是有一件事讓我看到了自己的嚴(yán)重不足,頗為羞愧。1996年,是SMAD蛋白發(fā)現(xiàn)及TGF-b信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究的最激動(dòng)人心的一年,哈佛醫(yī)學(xué)院的Whitman實(shí)驗(yàn)室在十月份的《自然》雜志上以“Article”的形式發(fā)表了一篇名為“A transcriptional partner for MAD proteins in TGF-b signaling”的文章。讀完之后,正好遇到TGF-b領(lǐng)域的著名學(xué)者Joan Massague,我對(duì)Joan評(píng)論說:I’m not so sure why this paper deserves a full article in Nature. They just identified another Smad-interacting protein, and the data quality is mediocre. 完全出乎我的意料,Joan馬上回應(yīng)我:I disagree! This paper links the cytoplasmic Smad protein into the nucleus and identifies a transcription factor as its interacting protein. Now the TGF-b signaling pathway is complete. It is a beautiful Nature article! 這件事對(duì)我觸動(dòng)極大:原來大師的視野和品位遠(yuǎn)遠(yuǎn)在我之上。從那以后,我也開始從整個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展方面來權(quán)衡一篇文章的重要性,這件事對(duì)我今后為國(guó)際重要學(xué)術(shù)期刊審稿、自己實(shí)驗(yàn)室選擇研究課題都起到了相當(dāng)重要的作用。
如今,我閱讀一篇本領(lǐng)域內(nèi)的科研論文,非常順利,而且常??梢钥闯鲆恍┳髡邲]有想到或分析到的關(guān)鍵點(diǎn)。回想從前,感慨萬千,感謝蒲慕明、鄭昌學(xué)、虞一華、John Desjarlais、Jeremy Berg、Joan Massague等一批老師和同事對(duì)我的幫助。我很留心,也很用心。
希望所有的學(xué)生也能通過努力和堅(jiān)持對(duì)英文科研論文的閱讀得心應(yīng)手!
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總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的文献阅读方法 如何阅读英文文献 - 施一公(转)的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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