近日，上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在DNA磷硫?；揎椃矫嫒〉猛黄疲禢ature Communications》在線發(fā)表了由德林教授研究小組的最新進(jìn)展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。DNA磷硫?；揎棌V泛存在于細(xì)菌中，與細(xì)菌的自我防衛(wèi)機(jī)制緊密相關(guān)，然而其序列特異性及在細(xì)菌基因組中的分布情況尚無報(bào)道。本工作以大腸桿菌Escherichia coliB7A為研究對(duì)象，建立了單分子實(shí)時(shí)測(cè)序（single molecule real-time sequencing，SMRT）和碘切割依賴的深度測(cè)序（deep sequencing of iodine-induced cleavage at PT，ICDS)兩種新穎的技術(shù)，測(cè)定了基因組水平DNA磷硫?；揎椢稽c(diǎn)，首次獲得了精確的細(xì)菌基因組磷硫酰化修飾位點(diǎn)分布圖譜。文章鏈接：http://www.nature.com/ncomms/2 ... .html

近日，從上海交通大學(xué)獲悉，該校微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室由德林研究小組在DNA磷硫?；揎椃矫嫒〉猛黄?。相關(guān)成果在線發(fā)表于《自然—通訊》雜志。DNA是生命的遺傳物質(zhì)，由碳、氫、氧、氮、磷五種元素組成。中科院院士鄧子新領(lǐng)銜的團(tuán)隊(duì)在前期工作中發(fā)現(xiàn)了DNA上存在一種全新的修飾——磷硫?；揎棥＿@一現(xiàn)象被國際同行公認(rèn)為“迄今為止在DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)天然修飾”，也是目前在DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第六種元素。由德林團(tuán)隊(duì)以大腸桿菌Escherichia coli B7A為研究對(duì)象，建立了單分子實(shí)時(shí)測(cè)序和碘切割依賴的深度測(cè)序等兩種前沿技術(shù)，測(cè)定了基因組水平DNA磷硫?；揎椢稽c(diǎn)，首次獲得了精確的細(xì)菌基因組磷硫酰化修飾位點(diǎn)分布圖譜。據(jù)了解，這兩種測(cè)序方法相互補(bǔ)充，測(cè)得修飾位點(diǎn)具有保守的GpsAAC/GpsTTC短序列特征。而大腸桿菌中同樣存在一個(gè)DNA磷硫酰化修飾—限制系統(tǒng)，并且其基因組中只有部分GAAC/GTTC位點(diǎn)被DNA磷硫酰化修飾酶識(shí)別修飾。該發(fā)現(xiàn)表明，DNA磷硫?；揎棥拗葡到y(tǒng)不同于經(jīng)典的甲基化修飾—限制系統(tǒng)，具有特殊的作用機(jī)制。

總結(jié)

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