HiSeq X Ten测序的结果可靠性如何?
生活随笔
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HiSeq X Ten测序的结果可靠性如何?
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從我了解的情況來看,該測序平臺的可靠性是較高的,在建庫成功的情況下,其測序質量完全滿足科研需要。,目前NEB建庫沒有問題,index分數據也沒有問題。數據質量很不錯。北京諾禾致源生物信息科技公司2014年6月19日和6月03日,已經對首批人重測序試驗結果進行了公開。在諾禾致源下機的第一批人類樣本結果顯示:該平臺在堿基準確度、測序均一性、可用數據比例、測序深度及覆蓋度等方面均表現優異,與上一代主流測序儀HiSeq2000旗鼓相當,而測序通量大大提升。其中,單張Flowcell 的數據產出達到了943.2 G,數據質量Q20 > 95%,Q30 > 88%,平均GC含量為43.6%。具體結果見鏈接:國內首批HiSeq X Ten人類樣本測序結果大公開中國首批HiSeq X Ten測序測試結果發布隨著儀器的穩定性在運行過程中進一步穩定和試劑的改進、實驗人員經驗的積累,測序質量應該會進一步提高。
本人認為可靠性還是比較高的。只要測序公司在運用HiSeq X Ten平臺時,在堿基準確度、測序均一性、可用數據比例方面的質量標準達到甚至超過Illumina官方提供的參考標準,基本上不會存在什么問題。HiSeq X 能夠在三天時間內生成 1.8 terabases 的數據,相當于 16 個人類基因組。據 Illumina 介紹,每臺 HiSeq X Ten 每年將能夠測序 18,000 個人類基因組。每個基因組都能夠達到覆蓋度 30x 的金標準,這意味著每個堿基平均被讀取 30 次。
本人認為可靠性還是比較高的。只要測序公司在運用HiSeq X Ten平臺時,在堿基準確度、測序均一性、可用數據比例方面的質量標準達到甚至超過Illumina官方提供的參考標準,基本上不會存在什么問題。HiSeq X 能夠在三天時間內生成 1.8 terabases 的數據,相當于 16 個人類基因組。據 Illumina 介紹,每臺 HiSeq X Ten 每年將能夠測序 18,000 個人類基因組。每個基因組都能夠達到覆蓋度 30x 的金標準,這意味著每個堿基平均被讀取 30 次。
總結
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