请说下proton测序仪的测序原理
生活随笔
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请说下proton测序仪的测序原理
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IonProton?系統提供了簡單的端到端工作流程,可快速獲得高質量的測序結果 IonTorrent備受期待的IonProton?系統可使外顯子組、全轉錄組和人類基因組規模的測序變得前所未有的方便、經濟?! onPI?芯片適用于外顯子組和轉錄組測序,是簡單、全面的工作流程——從文庫制備到數據分析——的一部分?! onPII?芯片可用于人類基因組規模的測序,預計將于IonProton?系統推出后約6個月問世?! onProton?系統工作流程包括優化的文庫試劑盒、自動化模板制備、快速測序運行和集成數據分析解決方案。2.1 1 文庫構造 Ion文庫試劑盒提供了簡單的高性能文庫解決方案,與Ion半導體測序系統結合使用,可用于外顯子組、轉錄組、基因組和靶點測序。2.2 2 模板制備 IonChef?系統?將為各種專業知識的用戶提供高通量的自動化模板制備和芯片加載。較低通量的用戶可選擇現已有售的IonOneTouch?2系統,實現全自動模板制備。2.3 3 運行測序 Proton?Torrent服務器預加載了TorrentSuite軟件,可用于堿基檢測、作圖、校準和變異體檢測。變異體可加載至IonReporter?軟件中,用于生物學闡釋和常見變異體的鑒定。2.4 4 分析數據 測序分析獲得的數據自動傳至裝有TorrentSuite軟件的Proton?Torrent服務器。Torrent軟件套裝將原始的電壓半導體測序數據處理為DNA堿基序列。3 系統數據處理3.1 采用先進的硬件可實現一天基因組測序 IonProton?系統是能夠實現$1,000基因組的唯一測序平臺*。它將是可在一天內提供人類基因組規模分析的第一臺儀器系統,包括數據處理、堿基檢測和變異體檢測。 IonProton?系統采用半導體技術,可提供在幾個小時內完成測序所需的速度,而且利用IonProton?測序儀中先進的電子設備,能夠一天內在Proton?Torrent服務器——IonProton?系統附帶的簡單的臺式服務器——上實現變異體檢測?! onProton?測序儀采用了最新、最先進的計算硬件(圖形處理器(GPU)和現場可編程門陣列(FPGA)技術),可在測序儀內部實現密集型計算數據處理。隨后在Proton?Torrent服務器上進行計算密集程度較低的堿基檢測和變異體檢測。 IonProton?系統將提供前所未有的速度和價格優勢,可在臺式測序儀和臺式服務器上實現外顯子組、轉錄組和人類基因組測序,而直到現在,完成這些操作仍需體積較大的測序儀和高端集群。4 優勢 新的IonProton?測序儀更上一層樓.憑借密度比IonPGM?測序儀高1000倍的芯片,IonProton?測序儀將使得全基因組測序對每個實驗室都觸手可及. 新的IonProton?測序儀是基于新一代的半導體測序技術,此技術已讓IonPGM?測序儀成為世界上銷售最快的測序儀.新的高通量芯片將實現讓IonProton?測序儀與IonPGM?測序儀相當的運行單日流程,來完成單個人類基因組的測序. IonProton?臺式測序儀,適合于每個實驗室,各種應用,各種預算。 IonProton測序儀,快速、簡捷、擴展,獨一無二的臺式基因組中心。5 主要應用領域 ? 擴增子測序擴增子測序是指利用PCR技術將基因組序列中的某個特定區域擴增出來進行測序,在臨床上有極大的應用。針對PGMTM測序儀,自主研發了擴增子測序高通量序列拼接、比對和分析程序,并與獨有的微生物分子標識數據庫相結合,將能將微生物菌株鑒定到種屬、血清型甚至菌株水平。? RNA單鏈測序RNA單鏈測序在轉錄組測序分析和small RNA測序分析領域具有重要應用價值,但目前市場上缺少原核生物RNA單鏈測序的試劑盒。結合前期積累的原核生物核糖體RNA消除技術,利用PGMTM測序儀建立了原核生物RNA單鏈測序標準化操作規程,并自主研發了配套的生物信息學分析程序,為原核生物的轉錄組測序和small RNA測序提供平臺和技術基礎。? 基因組及宏基因組測序與新一代測序相比,PGMTM測序儀具有更好的測序覆蓋均衡度,可以測序獲得新一代測序無法獲得的區域。將PGMTM測序儀與高通量的新一代測序儀(Solexa、Roche 454等)結合使用,可應用于基因組及宏基因組測序領域。
ion proton活不久了,開發該產品的首席已經走了,加盟三代測序去了。剛開始的454,他走了不多久,倒了。然后他開發了PGM,然后是proton,現在PGM基本廢了。而P2也出不來了?,F在又走了,估計不多久,Ion系列也要面臨生存問題了。
ion proton活不久了,開發該產品的首席已經走了,加盟三代測序去了。剛開始的454,他走了不多久,倒了。然后他開發了PGM,然后是proton,現在PGM基本廢了。而P2也出不來了?,F在又走了,估計不多久,Ion系列也要面臨生存問題了。
總結
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