《Science》报道"跳跃基因"介导癌症基因组中的非重复DNA转导?
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《Science》报道"跳跃基因"介导癌症基因组中的非重复DNA转导?
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由韋爾科姆基金會桑格學院研究所領導的一個研究組在新研究中,只鑒別出72個LINE-1元件在癌癥基因組中復制了自身,并發現LINE-1的甲基化對開關這些元件起至關重要的作用。這提示了一些有關環境因素對腫瘤演化影響的問題。17%的人類基因組都是由稱作為LINE-1元件的“寄生”重復dna片段構成,有時候這些LINE-1會自我復制并移動到基因組中新的位點。較為少見的是,它們會異常地撿起一塊鄰近的非LINE-1 DNA,將它復制到新的位點:這一過程被稱之為LINE-1轉導。通過檢測來自12種不同癌癥類型的290個腫瘤樣本,由領導韋爾科姆基金會桑格學院研究所的一個研究組發現了LINE-1元件唯獨在腫瘤中被動員的3,000個位點。在24%的位點中,LINE-1將一些非重復DNA片段轉導到了基因組的其他位點,有時候動員了外顯子,甚至整個基因。研究人員認為,這有可能是由于一些環境因素導致的甲基化水平發生改變所引起。研究人員開發出了一種算法來搜索癌癥樣本基因組,鑒別出了一些移動LINE-1元件的起始位點和隨后的位置。引人注目的是,從人類基因組的500,000個LINE-1元件中,該研究只鑒別出72個LINE-1元件在癌癥基因組中復制了自身。有兩個LINE-1元件導致了該研究中鑒別的三分之一的轉導事件。研究人員還在一個腫瘤中隨時間分析了LINE-1元件的活性。他們發現一些不同的元件在不同的位點活化和失活。
總結
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