测囊泡DNA是更灵敏的无创产前诊断方法吗?
生活随笔
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测囊泡DNA是更灵敏的无创产前诊断方法吗?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
在基于高通量測(cè)序的無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷中,科學(xué)家為了提高檢測(cè)準(zhǔn)確性、并節(jié)省測(cè)序成本,想了許多辦法。檢測(cè)囊泡DNA是一種新的大幅提高檢測(cè)準(zhǔn)確性的手段。這種方法的原理是:在懷孕2~3月齡時(shí),母親血液中約50%的囊泡是來(lái)自胎兒的。來(lái)自胎兒的囊泡中幾乎是純的胎兒DNA相比于血漿游離DNA中胎兒DNA占5~10%的比例,所有囊泡DNA中胎兒DNA的占比要高得多針對(duì)胎兒染色體異常,對(duì)囊泡DNA進(jìn)行測(cè)序,相對(duì)于測(cè)血漿游離DNA,檢出靈敏度會(huì)高許多
檢測(cè)囊泡DNA確實(shí)能夠大幅提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性。其方法大概可以概括為,取得血清后,用DNase酶進(jìn)行處理,DNase無(wú)法進(jìn)入囊泡,只能消化掉囊泡外的游離DNA。囊泡內(nèi)的DNA得以保存。再用Proteinase K蛋白消化酶處理,蛋白酶把DNase消化掉用苯酚/氯仿處理,把所有的蛋白(包括Proteinase K)變性破壞掉,同時(shí)也把囊泡的膜破掉,囊泡中的DNA釋放出來(lái)。水相用乙醇/異丙醇沉淀回收DNA,對(duì)回收的DNA進(jìn)行高通量測(cè)序(也可以考慮用DD-PCR或其它方法進(jìn)行定量檢測(cè))。檢測(cè)片段大小在200bp左右的血漿游離DNA,因?yàn)橹挥行∑蔚腄NA才更易透過(guò)母親與胎兒之間的胎盤(pán)屏障,進(jìn)入母親的血液中,所以母血中小片段(200bp)中,胎兒的DNA的占比會(huì)高,通過(guò)電泳/柱回收等手段,提取小片段DNA進(jìn)行高通量測(cè)序。這一方法已被多家實(shí)驗(yàn)室采用。相關(guān)文獻(xiàn): http://www.clinchem.org/content/50/6/1002.short。
檢測(cè)囊泡DNA確實(shí)能夠大幅提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性。其方法大概可以概括為,取得血清后,用DNase酶進(jìn)行處理,DNase無(wú)法進(jìn)入囊泡,只能消化掉囊泡外的游離DNA。囊泡內(nèi)的DNA得以保存。再用Proteinase K蛋白消化酶處理,蛋白酶把DNase消化掉用苯酚/氯仿處理,把所有的蛋白(包括Proteinase K)變性破壞掉,同時(shí)也把囊泡的膜破掉,囊泡中的DNA釋放出來(lái)。水相用乙醇/異丙醇沉淀回收DNA,對(duì)回收的DNA進(jìn)行高通量測(cè)序(也可以考慮用DD-PCR或其它方法進(jìn)行定量檢測(cè))。檢測(cè)片段大小在200bp左右的血漿游離DNA,因?yàn)橹挥行∑蔚腄NA才更易透過(guò)母親與胎兒之間的胎盤(pán)屏障,進(jìn)入母親的血液中,所以母血中小片段(200bp)中,胎兒的DNA的占比會(huì)高,通過(guò)電泳/柱回收等手段,提取小片段DNA進(jìn)行高通量測(cè)序。這一方法已被多家實(shí)驗(yàn)室采用。相關(guān)文獻(xiàn): http://www.clinchem.org/content/50/6/1002.short。
總結(jié)
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