什么是下一代测序技术(NGS)?
生活随笔
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什么是下一代测序技术(NGS)?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
下一代測序技術是一種迅速處理大量DNA的方法。實現下一代DNA測序的基本原理是在納米空洞中配置納米電極,用電測方法測量一個DNA的核酸堿基排列。NGS有兩大優勢:它既可以幫助人們確定治療方案,也可以為患兒父母評估他們未來子女患同樣病的風險。
NGS測序也稱為二代測序,不同平臺在通量、片段長度、準確度、測序成本、規格和技術方面存在存在差異。 從規格和初始成本的角度而言,二代測序儀器可輕松地分類為更窄的范圍,也就是所謂的“臺式測序儀”和高通量儀器。臺式測序儀使得任何實驗室都可以像使用real-time PCR一樣,自己進行測序。這些儀器可以和一些靶標序列富集技術相結合,用在一些臨床的應用中,其中:選定的靶標基因用于深度分析,以檢測稀有的突變,或者檢測多樣樣本中(比如癌癥樣本)中的突變。目前,這些儀器的通量在10 Mb到7.5 Gb之間,但是隨著硬件,軟件和試劑的持續改善,通量也在穩步增加。高通量測序儀非常適合于大量的,基因組范圍的研究,每次測序能測定600 Gb的序列。一些這樣的高通量和高精度的平臺,能測定的片段長度相對較短,這對于高重復性的序列和未知基因組的從頭測序就可能成為問題。與此相反,也有一些儀器能測序的片段較長(達到2500 bp),但是其精度和測序能力(90 Mb)要低很多。還有一些測序能力位于兩者之間的儀器(~800 bp,700 Mb)。
下一代測序就是我們常說的高通量測序,是相對于傳統的桑格測序而言的。目前高通量測序的主要平臺代表有羅氏公司的454測序儀,Illumina公司的Solexa基因組分析儀和ABI的SOLiD測序儀。高通量測序以其高輸出量與高解析度的特性,不僅為我們提供了豐富的遺傳學信息,而且使得測序的費用和時間大大縮短。在高通量測序發展的過程中,也有很多的問題需要我們去解決:數據在臨床診斷上的作用,測序數據的儲存和分析,數據的安全和信息隱私等。
NGS測序也稱為二代測序,不同平臺在通量、片段長度、準確度、測序成本、規格和技術方面存在存在差異。 從規格和初始成本的角度而言,二代測序儀器可輕松地分類為更窄的范圍,也就是所謂的“臺式測序儀”和高通量儀器。臺式測序儀使得任何實驗室都可以像使用real-time PCR一樣,自己進行測序。這些儀器可以和一些靶標序列富集技術相結合,用在一些臨床的應用中,其中:選定的靶標基因用于深度分析,以檢測稀有的突變,或者檢測多樣樣本中(比如癌癥樣本)中的突變。目前,這些儀器的通量在10 Mb到7.5 Gb之間,但是隨著硬件,軟件和試劑的持續改善,通量也在穩步增加。高通量測序儀非常適合于大量的,基因組范圍的研究,每次測序能測定600 Gb的序列。一些這樣的高通量和高精度的平臺,能測定的片段長度相對較短,這對于高重復性的序列和未知基因組的從頭測序就可能成為問題。與此相反,也有一些儀器能測序的片段較長(達到2500 bp),但是其精度和測序能力(90 Mb)要低很多。還有一些測序能力位于兩者之間的儀器(~800 bp,700 Mb)。
下一代測序就是我們常說的高通量測序,是相對于傳統的桑格測序而言的。目前高通量測序的主要平臺代表有羅氏公司的454測序儀,Illumina公司的Solexa基因組分析儀和ABI的SOLiD測序儀。高通量測序以其高輸出量與高解析度的特性,不僅為我們提供了豐富的遺傳學信息,而且使得測序的費用和時間大大縮短。在高通量測序發展的過程中,也有很多的問題需要我們去解決:數據在臨床診斷上的作用,測序數據的儲存和分析,數據的安全和信息隱私等。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的什么是下一代测序技术(NGS)?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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