比較常用的SNPs基因分型方法大致分為5大類,即直接測序法、單堿基延伸法、基于實時動態(tài)熒光PCR的Taq-Man法和等位基因特異擴增法、變性高效液相色譜(DHPLC)和OLA/PCR方法。其他方法還有:質(zhì)譜技術和熒光微陣列系統(tǒng)等。方法學選擇最主要的考量點是在什么儀器平臺,基因分型的通量大小,實驗結果的準確性、成功率,實驗操作的復雜性或?qū)嶒灹鞒痰拈L短,成本的高低,另外分型方法對樣品DNA量的要求也是一個參考指標。其中樣本數(shù)量的不同和通量的不同,對實驗成本和方法學選擇影響比較大。

說明一下特異等位基因PCR分型方法，這是一種新的高通量SNP基因分型方法,包括基因組DNA的PCR擴增,用兩端有特異等位基因的引物作為通用能量轉(zhuǎn)移標簽引物,使用熒光檢測儀可方便地檢測出發(fā)出的紅光和綠光。這種方法的優(yōu)點上對每個SNP僅需一次反應,可自動分型;反應只需在一個管中進行,能量標簽引物可連續(xù)使用,所需儀器也不昂貴。可應用于多個候選基因分析、基因組廣泛 掃描和疾病診斷。

總結

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