有人了解牛津纳米孔公司纳米孔测序仪MinIon吗?
生活随笔
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有人了解牛津纳米孔公司纳米孔测序仪MinIon吗?
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MinION能夠測序相當長的讀取。讀長受到片段大小的限制,MinION也許能測序長達50 kb的讀取。MinION能夠測序72小時,產生45,000個讀取,相當于277 MB的數據。MinION的流動槽上有512個孔。不過,對于目前的版本,測序過程中只有200-250個孔是激活的。
MinION的尺寸只有一支筆的長度,重大約100克,MinION可以直接通過USB鏈接到筆記本上,原始的電流信號通過網絡傳到英國的服務器上,進行Basecalling。納米孔測序能夠完整的把一條DNA鏈從頭測到尾,因此它的測序讀長就是DNA的長度,但是一般來說樣本制備時DNA會斷開,所以最長的reads長達120kb。一個MinION有500個納米孔在并行測序,每個孔每秒測30bp,因此,要測到1G的數據,需要3天時間。
MinION的尺寸只有一支筆的長度,重大約100克,MinION可以直接通過USB鏈接到筆記本上,原始的電流信號通過網絡傳到英國的服務器上,進行Basecalling。納米孔測序能夠完整的把一條DNA鏈從頭測到尾,因此它的測序讀長就是DNA的長度,但是一般來說樣本制備時DNA會斷開,所以最長的reads長達120kb。一個MinION有500個納米孔在并行測序,每個孔每秒測30bp,因此,要測到1G的數據,需要3天時間。
總結
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