2010年,芬蘭赫爾辛基大學(xué)Taipale研究組提出多重大規(guī)模并行SELEX(MMP-SELEX)技術(shù),用于測定人轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合譜。他們采用此技術(shù)繪制了屬于14種不同種類的19個轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合譜,并用體內(nèi)技術(shù)ChIP-Seq實(shí)驗(yàn)確證了轉(zhuǎn)錄因子NFATC1和RFX3的特異性。該技術(shù)的實(shí)驗(yàn)原理及流程見圖6,該技術(shù)實(shí)質(zhì)上是基于微孔板偶聯(lián)DNA結(jié)合蛋白,進(jìn)行高效自動化蛋白結(jié)合寡核苷酸篩選的SELEX新方法,篩選產(chǎn)物使用高通量DNA測序技術(shù),如Illumina Solexa,進(jìn)行解碼測定。該研究建立了一套完整的研究真核轉(zhuǎn)錄因子蛋白DNA結(jié)合特異性的SELEX篩選方案和多重測序技術(shù)方案,為該類研究提供了經(jīng)典程序,對該類研究必將產(chǎn)生巨大的推動作用。

總結(jié)

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