人工合成大片段基因的瓶颈是什么?
生活随笔
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人工合成大片段基因的瓶颈是什么?
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人工合成大片段基因第一步就是合成長核苷酸鏈的問題,因為核苷酸是一個個加上去的,即使每一步得率都很高,但一旦長了就沒有辦法。現在我們在invitrogen合成引物(單核苷酸鏈),單條在56個(好像?)核苷酸以下的一個價,56個以上的另一個價,最長不能超過120個,這似乎就是目前用固相亞磷酰胺三酯法合成引物的極限了。因為基因組是雙鏈的,我們可以通過合成互補的兩條單鏈退火得到需要的雙鏈,這樣得到的不過是一百來個堿基對的DNA雙鏈。而最小的有細胞結構的生物的基因組也有160kb之巨。為了得到更長的DNA雙鏈,我們可以用分子生物學的工具來做到。比如,在模板存在的情況下,我們可以通過PCR的方法,使用高保真的聚合酶,一次性擴增產生10kb以上的片段;我們還可以通過限制性內切酶和連接酶的工具,將多個DNA片段連結上;我們也能通過使用quikchange誘變的方法對DNA序列進行小范圍的修改;我們還能通過BAC、YAC等載體將得到的超長片段在細菌或酵母內保藏、擴增。如果不考慮基因組的裝配,以現在的技術,我們是能夠獲得長達一萬kb的DNA雙鏈的,請看這貨的工作:JCVI: First Self-Replicating, Synthetic Bacterial Cell Constructed by J. Craig Venter Institute Researchers。基因合成無法做到像3D打印的原因是尺度不同,3D打印是在宏觀尺度上材料的構筑,而基因合成是在分子尺度上的化學反應,它們的原材料服從的物理規律不一樣。除非咱能得心應手地操作單分子。如果我們硬要從一堆無機物,de novo做一個生命出來,俺不知道還有多遠,不過樂觀估計是以十年為單位計算的。這個問題可能是沒有意義的,因為以現有的生物資源,我們似乎只用在它們的基礎上進行修改、不斷地修改,就能夠滿足人類的需求了。而這樣的事情,不是有人在做么?此所謂:轉基因。
總結
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