下一代测序技术主要有哪些方面的应用?
生活随笔
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下一代测序技术主要有哪些方面的应用?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
補充一下前幾樓回答。目前高通量測序正開始廣泛應用于尋找疾病的候選基因上。內梅亨大學的研究人員使用這種方法鑒定出Schinzel-Giedion 綜合征中的致病突變,Schinzel-Giedion綜合征是一種導致嚴重的智力缺陷、腫瘤高發以及多種先天性畸形的罕見病。他們使用Agilent SureSelect序列捕獲和SOLiD對四位患者的外顯子組進行測序,平均覆蓋度為43倍,讀長為50 nt,每個個體產生了2.7-3 GB可作圖的序列數據。他們聚焦于全部四位患者都攜帶變異體的12個基因,最終將候選基因縮小至1個。而貝勒醫學院基因組測序中心也計劃對15種以Science雜志年度十大科學突破上疾病進行研究,包括腦癌、肝癌、胰腺癌、結腸癌、卵巢癌、膀胱癌、心臟病、糖尿病、自閉癥以及其他遺傳疾病,以更好地理解致病突變以及突變對疾病的影響。前不久剛剛結束的評選中,外顯子組測序名列其中。
對于測序,別光停留在純測序上,比如基因組測序,RNA測序等等,雖然這方面發展很快,大到全基因組,或者深度很深通量很大,小到單細胞。對于其他技術運用結合測序也是測序發展的突破,比如曾經運用二代測序的ChIP-Seq,通過免疫共沉淀,得到dna,然后測序,精確度遠遠高于ChIP-chip,此外GRO-Seq, Bisulfite sequencing 都是依托測序實現新鮮rna或者甲基化分析,特別是CRISPR screening,需要deep sequecing 實現sgRNA的比價分析。測序是手段,而不是目的。測序結合其他的生物技術,也是測序發展的一條途徑。
下一代測序在生物制藥領域和疫苗生產中有著越來越多的使用。對微生物基因組的研究,看幫助找到細菌耐藥基因,從而幫助開發新的抗細菌和抗病毒藥物。在疫苗生產過程中,加入測序這一環節,可以幫助避免生產過程中的外源病毒污染。此外,下一代測序還可以改進抗體庫的構建,能更加快速和低成本的完成抗體庫構建。
下一代測序技術不斷進步的同時,它他在臨床領域的應用快速增長,目前比較熱門的應用是:研究者選擇下一代測序的多基因panel對腫瘤進行研究,或者通過外顯子測序鑒定潛在的藥物靶點。最近,美國佛羅里達大學科學家利用大范圍下一代DNA測序技術進行的研究對一些常見蝴蝶和飛蛾的將近3000個基因進行跟蹤研究,制作出一份涵蓋廣泛的“鱗翅目樹”。
隨著人類基因組工程的完成,對于低花費的測序技術的需求促進了高通量二代測序技術的發展。這些新的測序平臺允許進行高通量測序,也就是本題中所說的下一代測序技術,其在科學研究的應用主要有以下幾個方面:全基因組從頭測序或者重測序目標序列重測序轉錄組分析微生物組研究基因調控研究此外還在臨床診斷方面具有很多的應用,但主要用于無創產前診斷和疾病相關基因的檢測。
下一代測序技術的一個新興的應用領域是單細胞 RNA 測序;最近挺多文獻提到這方面的應用,未來可能會得到廣泛的應用。
對于測序,別光停留在純測序上,比如基因組測序,RNA測序等等,雖然這方面發展很快,大到全基因組,或者深度很深通量很大,小到單細胞。對于其他技術運用結合測序也是測序發展的突破,比如曾經運用二代測序的ChIP-Seq,通過免疫共沉淀,得到dna,然后測序,精確度遠遠高于ChIP-chip,此外GRO-Seq, Bisulfite sequencing 都是依托測序實現新鮮rna或者甲基化分析,特別是CRISPR screening,需要deep sequecing 實現sgRNA的比價分析。測序是手段,而不是目的。測序結合其他的生物技術,也是測序發展的一條途徑。
下一代測序在生物制藥領域和疫苗生產中有著越來越多的使用。對微生物基因組的研究,看幫助找到細菌耐藥基因,從而幫助開發新的抗細菌和抗病毒藥物。在疫苗生產過程中,加入測序這一環節,可以幫助避免生產過程中的外源病毒污染。此外,下一代測序還可以改進抗體庫的構建,能更加快速和低成本的完成抗體庫構建。
下一代測序技術不斷進步的同時,它他在臨床領域的應用快速增長,目前比較熱門的應用是:研究者選擇下一代測序的多基因panel對腫瘤進行研究,或者通過外顯子測序鑒定潛在的藥物靶點。最近,美國佛羅里達大學科學家利用大范圍下一代DNA測序技術進行的研究對一些常見蝴蝶和飛蛾的將近3000個基因進行跟蹤研究,制作出一份涵蓋廣泛的“鱗翅目樹”。
隨著人類基因組工程的完成,對于低花費的測序技術的需求促進了高通量二代測序技術的發展。這些新的測序平臺允許進行高通量測序,也就是本題中所說的下一代測序技術,其在科學研究的應用主要有以下幾個方面:全基因組從頭測序或者重測序目標序列重測序轉錄組分析微生物組研究基因調控研究此外還在臨床診斷方面具有很多的應用,但主要用于無創產前診斷和疾病相關基因的檢測。
下一代測序技術的一個新興的應用領域是單細胞 RNA 測序;最近挺多文獻提到這方面的應用,未來可能會得到廣泛的應用。
總結
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