唾液取样能够上NGS么,样品量够不够?
生活随笔
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唾液取样能够上NGS么,样品量够不够?
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
DNA Genotek的那個Og-500就是為全基因組設計的吧
曾有實驗顯示是搜集700ul唾液能夠提取獲得約18ug gDNA,這一個方面可能是唾液中gDNA含量不等等原因有關,就算我們按照1ml 唾液大約最多能夠提取獲得~200ng gDNA來計算:NGS平臺,如果是最常用的HiSeq 2000,需要1.2ug最低起始量來構建常規shotgun文庫;若構建designated insert size shotgun library則最低起始量需要3.0ug。HiSeq X Ten測序平臺文庫構建起始量也需要2-3.0ug。可見一次搜集提取量是不太夠的,可以通過多次采集唾液來進行搜集,不過建議直接采集外周血更為方便,希望對您問題的解決有幫助。
曾有實驗顯示是搜集700ul唾液能夠提取獲得約18ug gDNA,這一個方面可能是唾液中gDNA含量不等等原因有關,就算我們按照1ml 唾液大約最多能夠提取獲得~200ng gDNA來計算:NGS平臺,如果是最常用的HiSeq 2000,需要1.2ug最低起始量來構建常規shotgun文庫;若構建designated insert size shotgun library則最低起始量需要3.0ug。HiSeq X Ten測序平臺文庫構建起始量也需要2-3.0ug。可見一次搜集提取量是不太夠的,可以通過多次采集唾液來進行搜集,不過建議直接采集外周血更為方便,希望對您問題的解決有幫助。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的唾液取样能够上NGS么,样品量够不够?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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