下一代测序(NGS)技术的发展前景如何?在常规实验室是否可以推广?
生活随笔
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下一代测序(NGS)技术的发展前景如何?在常规实验室是否可以推广?
小編覺(jué)得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
有著很好的發(fā)展前景。“下一代測(cè)序(NGS)”技術(shù)將在解開(kāi)傳染病謎團(tuán)中的具有更廣泛應(yīng)用:不僅可用于前沿的研究機(jī)構(gòu),而且可用于隨處可見(jiàn)的、醫(yī)生可以接近的臨床實(shí)驗(yàn)室。采用NGS技術(shù)大大縮短了樣品采集和可行診斷之間所需的時(shí)間,幫助威斯康星大學(xué)的一個(gè)醫(yī)療小組挽救了年輕患者的生命。這項(xiàng)研究將實(shí)時(shí)DNA測(cè)序、龐大的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(用于識(shí)別病原體和其他生物體)和先進(jìn)的計(jì)算分析工具(快速分析數(shù)百萬(wàn)個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn))融合起來(lái),不僅可以同時(shí)識(shí)別患者樣本中的所有DNA,而且無(wú)需培養(yǎng)或靶定特定的傳染病原體。從成本和周轉(zhuǎn)時(shí)間的角度來(lái)看,這是一項(xiàng)非常強(qiáng)大的技術(shù),已成為切實(shí)可用的臨床實(shí)驗(yàn)室常規(guī)實(shí)施技術(shù)。”
我覺(jué)得每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都要搞數(shù)據(jù)挖掘,最后會(huì)有技術(shù)牛的將數(shù)據(jù)挖掘的很好,NGS數(shù)據(jù)挖掘才是關(guān)鍵。
發(fā)展前景非常好,尤其是在癌癥個(gè)性話治療方面,NGS通過(guò)廣泛的基因篩查,預(yù)測(cè)癌癥的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),幫助醫(yī)生確定癌癥不同亞型的特異性療法,在實(shí)現(xiàn)癌癥個(gè)性化治療的道路上,下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)發(fā)揮著不可取代的作用。在過(guò)去的幾年里,NGS變得更加精確,它幫助研究人員和病理學(xué)家實(shí)現(xiàn)了從單基因檢測(cè)到多基因檢測(cè)的完美轉(zhuǎn)換,當(dāng)然可以在實(shí)驗(yàn)室推廣這么好的技術(shù)。
我個(gè)人覺(jué)得沒(méi)必要在常規(guī)實(shí)驗(yàn)室推廣,因?yàn)槭紫葍x器設(shè)備的購(gòu)買(mǎi)需要一定的費(fèi)用,一般這筆錢(qián)不是小數(shù)目,設(shè)備購(gòu)買(mǎi)之后需要維護(hù)等等一系列的后續(xù)工作,最關(guān)鍵的如何使用設(shè)備,又需要培訓(xùn)專(zhuān)業(yè)人員或者雇傭一定的人員,而且對(duì)于常規(guī)實(shí)驗(yàn)室的使用頻率不是很高,所以我個(gè)人認(rèn)為目前沒(méi)必要大范圍推廣,還不如將測(cè)序外包給一些專(zhuān)業(yè)的公司,省錢(qián)省力,前提是需要保證數(shù)據(jù)的可靠性。
有廣泛的應(yīng)用前景 在下一代測(cè)序技術(shù)不斷進(jìn)步的同時(shí),它的應(yīng)用也越來(lái)越廣泛。據(jù) Mardis 介紹,下一代測(cè)序在臨床領(lǐng)域的應(yīng)用快速增漲。越來(lái)越多的研究者選擇下一代測(cè)序的多基因 panel 對(duì)腫瘤進(jìn)行研究,或者通過(guò)外顯子測(cè)序鑒定潛在的藥物靶點(diǎn)。在診斷兒童遺傳學(xué)疾病時(shí),人們也逐漸拋開(kāi)了傳統(tǒng)的診斷方法,轉(zhuǎn)而使用全外顯子組測(cè)序。 Mardis 補(bǔ)充到, NGS 檢測(cè)有兩大優(yōu)勢(shì),它既可以幫助人們確定治療方案,也可以為患兒父母評(píng)估他們未來(lái)子女患同樣疾病的風(fēng)險(xiǎn)。實(shí)際上 Church 認(rèn)為,用下一代測(cè)序進(jìn)行(致病基因)攜帶者篩查,是 NGS 的“殺手锏”. “任何考慮使用輔助生殖手段的人,應(yīng)當(dāng)知道精子捐獻(xiàn)者是否攜帶與嚴(yán)重疾病有關(guān)的隱性等位基因,”他說(shuō)。“人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百個(gè)能夠預(yù)測(cè)疾病的基因,現(xiàn)在也有不少服務(wù)可以對(duì)它們進(jìn)行準(zhǔn)確的檢測(cè)。” 最近, Church 作為共同作者發(fā)表了一項(xiàng)新研究。據(jù)他介紹,這是首次發(fā)表用 NGS 進(jìn)行攜帶者篩查的文章,他們的方法“充分提高了質(zhì)量并且降低了成本”.研究團(tuán)隊(duì)使用padlock探針,在194個(gè)細(xì)胞系中抽出并測(cè)序了15個(gè)有臨床意義的基因,其中55個(gè)細(xì)胞系來(lái)自于攜帶上述基因突變的個(gè)體。 下一代測(cè)序的另一個(gè)新興的應(yīng)用領(lǐng)域是單細(xì)胞 RNA 測(cè)序。單細(xì)胞 RNA 測(cè)序能向我們展示,相同細(xì)胞中 RNA 表達(dá)的天然隨機(jī)性,這一點(diǎn)非常吸引人。 Church 即將發(fā)表的一篇文章描述了一種新的測(cè)序方案,稱(chēng)為熒光原位測(cè)序(fluorescent in situ sequencing)。這一技術(shù)將熒光原位雜交和 RNA -Seq結(jié)合起來(lái),能夠計(jì)數(shù)并確定不同轉(zhuǎn)錄本在組織切片中的空間定位。 Church 的團(tuán)隊(duì)通過(guò)熒光原位測(cè)序證實(shí),轉(zhuǎn)錄本會(huì)依據(jù)傷口的愈合情況在成纖維細(xì)胞中呈不對(duì)稱(chēng)分布。 這樣的數(shù)據(jù)在十年前簡(jiǎn)直難以想象。同樣,我們也很難想象 NGS 在未來(lái)十年又會(huì)發(fā)生怎樣的翻天覆地的變化。
前景肯定是不錯(cuò)的,但目前推廣好像比較困難,偌大的中國(guó)也沒(méi)幾臺(tái)啊,挺使用過(guò)的人說(shuō),這個(gè)技術(shù)可能發(fā)展還不是很成熟,儀器穩(wěn)定性性能可能不是很好,用起來(lái)還是有點(diǎn)繁瑣,要是不穩(wěn)定就更加麻煩了,所以要推廣,技術(shù)還有待改進(jìn)。
我覺(jué)得每個(gè)實(shí)驗(yàn)室都要搞數(shù)據(jù)挖掘,最后會(huì)有技術(shù)牛的將數(shù)據(jù)挖掘的很好,NGS數(shù)據(jù)挖掘才是關(guān)鍵。
發(fā)展前景非常好,尤其是在癌癥個(gè)性話治療方面,NGS通過(guò)廣泛的基因篩查,預(yù)測(cè)癌癥的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),幫助醫(yī)生確定癌癥不同亞型的特異性療法,在實(shí)現(xiàn)癌癥個(gè)性化治療的道路上,下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)發(fā)揮著不可取代的作用。在過(guò)去的幾年里,NGS變得更加精確,它幫助研究人員和病理學(xué)家實(shí)現(xiàn)了從單基因檢測(cè)到多基因檢測(cè)的完美轉(zhuǎn)換,當(dāng)然可以在實(shí)驗(yàn)室推廣這么好的技術(shù)。
我個(gè)人覺(jué)得沒(méi)必要在常規(guī)實(shí)驗(yàn)室推廣,因?yàn)槭紫葍x器設(shè)備的購(gòu)買(mǎi)需要一定的費(fèi)用,一般這筆錢(qián)不是小數(shù)目,設(shè)備購(gòu)買(mǎi)之后需要維護(hù)等等一系列的后續(xù)工作,最關(guān)鍵的如何使用設(shè)備,又需要培訓(xùn)專(zhuān)業(yè)人員或者雇傭一定的人員,而且對(duì)于常規(guī)實(shí)驗(yàn)室的使用頻率不是很高,所以我個(gè)人認(rèn)為目前沒(méi)必要大范圍推廣,還不如將測(cè)序外包給一些專(zhuān)業(yè)的公司,省錢(qián)省力,前提是需要保證數(shù)據(jù)的可靠性。
有廣泛的應(yīng)用前景 在下一代測(cè)序技術(shù)不斷進(jìn)步的同時(shí),它的應(yīng)用也越來(lái)越廣泛。據(jù) Mardis 介紹,下一代測(cè)序在臨床領(lǐng)域的應(yīng)用快速增漲。越來(lái)越多的研究者選擇下一代測(cè)序的多基因 panel 對(duì)腫瘤進(jìn)行研究,或者通過(guò)外顯子測(cè)序鑒定潛在的藥物靶點(diǎn)。在診斷兒童遺傳學(xué)疾病時(shí),人們也逐漸拋開(kāi)了傳統(tǒng)的診斷方法,轉(zhuǎn)而使用全外顯子組測(cè)序。 Mardis 補(bǔ)充到, NGS 檢測(cè)有兩大優(yōu)勢(shì),它既可以幫助人們確定治療方案,也可以為患兒父母評(píng)估他們未來(lái)子女患同樣疾病的風(fēng)險(xiǎn)。實(shí)際上 Church 認(rèn)為,用下一代測(cè)序進(jìn)行(致病基因)攜帶者篩查,是 NGS 的“殺手锏”. “任何考慮使用輔助生殖手段的人,應(yīng)當(dāng)知道精子捐獻(xiàn)者是否攜帶與嚴(yán)重疾病有關(guān)的隱性等位基因,”他說(shuō)。“人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)百個(gè)能夠預(yù)測(cè)疾病的基因,現(xiàn)在也有不少服務(wù)可以對(duì)它們進(jìn)行準(zhǔn)確的檢測(cè)。” 最近, Church 作為共同作者發(fā)表了一項(xiàng)新研究。據(jù)他介紹,這是首次發(fā)表用 NGS 進(jìn)行攜帶者篩查的文章,他們的方法“充分提高了質(zhì)量并且降低了成本”.研究團(tuán)隊(duì)使用padlock探針,在194個(gè)細(xì)胞系中抽出并測(cè)序了15個(gè)有臨床意義的基因,其中55個(gè)細(xì)胞系來(lái)自于攜帶上述基因突變的個(gè)體。 下一代測(cè)序的另一個(gè)新興的應(yīng)用領(lǐng)域是單細(xì)胞 RNA 測(cè)序。單細(xì)胞 RNA 測(cè)序能向我們展示,相同細(xì)胞中 RNA 表達(dá)的天然隨機(jī)性,這一點(diǎn)非常吸引人。 Church 即將發(fā)表的一篇文章描述了一種新的測(cè)序方案,稱(chēng)為熒光原位測(cè)序(fluorescent in situ sequencing)。這一技術(shù)將熒光原位雜交和 RNA -Seq結(jié)合起來(lái),能夠計(jì)數(shù)并確定不同轉(zhuǎn)錄本在組織切片中的空間定位。 Church 的團(tuán)隊(duì)通過(guò)熒光原位測(cè)序證實(shí),轉(zhuǎn)錄本會(huì)依據(jù)傷口的愈合情況在成纖維細(xì)胞中呈不對(duì)稱(chēng)分布。 這樣的數(shù)據(jù)在十年前簡(jiǎn)直難以想象。同樣,我們也很難想象 NGS 在未來(lái)十年又會(huì)發(fā)生怎樣的翻天覆地的變化。
前景肯定是不錯(cuò)的,但目前推廣好像比較困難,偌大的中國(guó)也沒(méi)幾臺(tái)啊,挺使用過(guò)的人說(shuō),這個(gè)技術(shù)可能發(fā)展還不是很成熟,儀器穩(wěn)定性性能可能不是很好,用起來(lái)還是有點(diǎn)繁瑣,要是不穩(wěn)定就更加麻煩了,所以要推廣,技術(shù)還有待改進(jìn)。
總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的下一代测序(NGS)技术的发展前景如何?在常规实验室是否可以推广?的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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