能通过数据分析方法区分肿瘤中的不同类型癌细胞吗?
生活随笔
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能通过数据分析方法区分肿瘤中的不同类型癌细胞吗?
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可以的。美國一個研究所今年新研發出一種新的數據統計模型,叫做GLAD,能利用腫瘤RNA測序的數據分析腫瘤中的癌細胞類型及比例。這種模型改進了過去對于腫瘤細胞分類采取的“全或無”模式,即針對一種腫瘤只能發現其中最主要類型的癌細胞。這樣的診斷方法可能對后期治療有誤導作用,畢竟每種藥物一般只能針對一種癌細胞有效,而對腫瘤中的其他類型癌細胞可能完全沒用。這種新研發的GLAD模型能夠較準確的判斷腫瘤組織中各類型癌細胞的相對比例,這對于后期的個性化治療是很有幫助的,可以使醫生采用聯合治療方法對付腫瘤組織中的各種癌細胞,調整用藥方案和方法。這種模型被命名為GLAD,主要源于它利用了三種統計分布函數,分別是高斯、拉普拉斯和狄利克雷(Gaussian, Laplace, and Dirichlet)。它的使用主要基于腫瘤組織的RNA-seq數據,通過分析各基因表達量的情況來獲取腫瘤中癌細胞種類。最早,這種方法被應用于一組模擬數據,該數據模擬了一種腫瘤中的兩類癌細胞,GLAD成功識別出兩種細胞的各自比例。之后,GLAD又利用一組含有小鼠肺、腦和肝細胞樣本的基因表達數據進行分析,也成功再現了這些細胞的比例。最后,科研團隊還從癌癥基因組圖譜項目中找到了202例惡性膠質瘤的基因表達數據,利用GLAD方法進行分析,成功確認了這些膠質瘤中的四類癌細胞,并準確預測了每一類的比例。這些驗證和測試體現了此方法的可行性,據研究團隊透露,下一步他們將與一些臨床機構合作,使用這個方法來對乳腺癌病人進行測試,希望能將這個方法應用于病人小樣本活檢,以將檢測結果與病人癥狀關聯,確定下一步的用藥方案。
總結
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