为什么缠绕在核小体上变成了左手螺旋?
生活随笔
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为什么缠绕在核小体上变成了左手螺旋?
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雙鏈螺旋纏繞在一起,會產生張力(tension),為了消解這種張力,在高一級結構上的螺旋,會與原來的雙鏈螺旋方向相反。也就是說,右手螺旋DNA的高級結構就會采用左手螺旋,所以會以左手螺旋的形式纏繞在核小體上。同樣大多數(canonical)核小體上DNA纏繞是左手螺旋。在染色體進行轉錄翻譯或者其他活動時,有時需要形成一些一些無核小體區域(nucleosome-depleted-region),比如promoter region,使其他參與蛋白能和DNA結合讀取信息。左手螺旋的方式可以使核小體移除的同時melting DNA, 從而促進其他蛋白對DNA序列的信息讀取和結合。實際上,右手螺旋的核小體也被觀測到過,叫做reversome。 (ref:Bancaud et al,2007)比核小體更高一級的染色體結構叫30-nm chromatin fiber。具體結構還有爭議,主要有one-start和two-start兩種模型,一般認為是left-handed。更高級的結構就不再是簡單的螺旋,會形成很多short-/long-distance和intra—/inter-chromatin fiber interaction?,F在有5c 和 high c等不同的方法測定。
總結
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