目前高通量测序有什么瓶颈呢?近几年可以突破吗?
生活随笔
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目前高通量测序有什么瓶颈呢?近几年可以突破吗?
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長度,價格
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我來談一談瓶頸: 由于因特網的帶寬限制,將數據傳入云端也許才是最大的一個障礙,尤其是在數據集特別大的時候。,以傳輸速率為5–10MB/s的網絡連接為例,傳100GB的二代測序數據集將需要一個星期。雖然數據傳輸速度自2010年以來有所提高,但也跟不上測序數據的猛增,數據傳輸仍舊是云用戶面臨的一大問題。“數據傳輸速率還是主要的瓶頸,”Stein說。
根據目前的幾種測序方法看,測序精度不是問題,測序時間也還好(從20分鐘到2周不等,取決于方法及測序長度),但是設備比較昂貴,如果通過技術改進,將成本降下來,高通量會有很好的發展。
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我來談一談瓶頸: 由于因特網的帶寬限制,將數據傳入云端也許才是最大的一個障礙,尤其是在數據集特別大的時候。,以傳輸速率為5–10MB/s的網絡連接為例,傳100GB的二代測序數據集將需要一個星期。雖然數據傳輸速度自2010年以來有所提高,但也跟不上測序數據的猛增,數據傳輸仍舊是云用戶面臨的一大問題。“數據傳輸速率還是主要的瓶頸,”Stein說。
根據目前的幾種測序方法看,測序精度不是問題,測序時間也還好(從20分鐘到2周不等,取決于方法及測序長度),但是設備比較昂貴,如果通過技術改進,將成本降下來,高通量會有很好的發展。
總結
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