一个基因序列在亲本以中有80bp左右插入,另一亲本中没有,该怎么分析酶切位点设计特异标记
生活随笔
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一个基因序列在亲本以中有80bp左右插入,另一亲本中没有,该怎么分析酶切位点设计特异标记
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1. 首先需要對這個基因序列進行比對,找出親本間的差異部分,并確定插入的具體位置。
2. 然后可以在這個插入部位周圍,設計一對特異性酶切位點,保證這對酶只在存在插入的親本中被切割,而在另一親本中不被切割。
3. 可以使用PCR擴增這個基因的片段,在擴增產物中檢測特異性酶切位點是否存在,確定這對位點是否能夠產生特異標記。
4. 最后,根據擴增產物的大小以及特異性酶切位點的分布情況,可以設計合適的分析方法,如限制性片段長度多態性(RFLP)或引物擴增長度多態性(AFLP)等,產生特異的標記來進行遺傳分析。
總結
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