“我們一旦使用計算機來盡可能地去拼接2.5萬個嗜血桿菌基因組的全部片段時，最后得到叫做重疊群的較大碎塊，該碎塊由一套重疊的DNA片段組成。為了把重疊群裝配成基因組，我想我們可以從幾百個任意λ克隆體的兩端比較序列。如果一個λ克隆體的一端與一個重疊群相匹配，另一端與另一個重疊群匹配，那我們自然就知道這兩個重疊群的次序和定位了。”---全基因霰彈槍測序法

[美]克雷格.文特爾_《第一推動叢書》解碼生命

蛋白質(zhì)有一個特征的形態(tài)，與環(huán)境無關(guān)。這意味著蛋白質(zhì)作為一種形態(tài)他的分類環(huán)境就是蛋白質(zhì)本身。所以蛋白質(zhì)的最終形態(tài)僅取決于組成蛋白質(zhì)的氨基酸和氨基酸片段之間的相互作用。

氨基酸與氨基酸之間的相互作用是化學作用，但作用的結(jié)果一定有一個外部形態(tài)的表象。最終的外部形態(tài)對應著化學作用的平衡態(tài)，因此氨基酸與氨基酸或者氨基酸段落和氨基酸段落之間的化學作用的結(jié)果可以用兩個形態(tài)之間的差異來等價的描述。而兩個形態(tài)之間的差異的大小顯然就是收斂誤差一定時的迭代次數(shù)，

所以如果用類似霰彈槍的方法把蛋白質(zhì)分割成一定數(shù)量的片段，并在已知的蛋白質(zhì)中收集片段與片段之間形態(tài)差異的平衡迭代次數(shù)，并且通過旋轉(zhuǎn)拉伸等方法把未知的片段與片段之間的迭代次數(shù)調(diào)整為平衡迭代次數(shù)，得到的是這個未知蛋白質(zhì)的最優(yōu)結(jié)構(gòu)嗎？

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的蛋白质折叠的霰弹枪方法的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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