相關(guān)性熱圖可以便捷的顯示多個變量之間的相關(guān)性，因此在組學數(shù)據(jù)分析中得到廣泛應(yīng)用，例如基因的共表達分析、樣本重復(fù)檢驗、微生物群落的共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)分析等。

在昨天推文下就有人問熱圖怎么畫？畫熱圖最常規(guī)的辦法自然是R語言。

R中的Cor()函數(shù)可快速計算兩變量間的相關(guān)系數(shù)，corrplot可繪制相關(guān)性熱圖。此外，半夏往期也曾給大家分享過使用Excel中的Pearson (array1, array2)函數(shù)計算兩變量間的Pearson相關(guān)系數(shù)并繪圖(具體可見：如何優(yōu)雅的使用Excel作出高大上的圖片)。下圖是使用Excel條件格式下的色階繪制的相關(guān)性系數(shù)圖：

Excel繪制的相關(guān)性熱圖方框顏色深淺為Pearson相關(guān)系數(shù)的大小，不能用圓圈、橢圓來顯示系數(shù)，也不能顯示P值。

那么如何無代碼繪制下圖這種高大上的相關(guān)性熱圖呢？今天半夏就給大家分享無代碼高效繪制各種高大上的相關(guān)性熱圖的技能。

Origin軟件安裝

1.1 Origin軟件安裝

Origin是科學研究中高端圖表和數(shù)據(jù)分析必備軟件之一。雖然作為商業(yè)軟件Origin較為昂貴，但中國學生可以通過edu.cn結(jié)尾的郵箱注冊獲得免費正版Origin學習軟件，鏈接：https://www.originlab.com/OriginProLearning.aspx 。本次使用軟件版本為OriginPro 2020b (64-bit)。

1.2 Correlation Plot App安裝

Origin有許多功能強大的App，可通過進入Origin官網(wǎng)https://www.originlab.com/ ，點擊App，尋找需要的App下載。

Correlation Plot App可用于在圖形中顯示包含其P值的相關(guān)系數(shù)矩陣。按照郵件提示信息安裝Origin軟件后打開軟件，在最右側(cè)Apps處選擇Add Apps，在App Center安裝Correlation Plot App：

安裝完成后即可在Apps處顯示Correlation Plot App：

Correlation Plot App繪制相關(guān)性熱圖

步驟：

1. 打開Origin,輸入示例數(shù)據(jù)，示例數(shù)據(jù)為不同Gene在各樣本間的表達水平：

2. 在Apps下點擊Correlation Plot App，界面如下：

點擊Select All選中所有數(shù)據(jù)：

因為我們是計算樣本與樣本之間基因表達的相關(guān)性，鼠標點擊A列X1數(shù)據(jù)，取消選擇A列，點擊Auto Preview即可預(yù)覽當前設(shè)置下的相關(guān)性熱圖：

點擊OK得到漂亮的相關(guān)性熱圖：

相關(guān)參數(shù)設(shè)置

3.1 Method

有Circle、Ellipse、Color、Number與Mixed 5個選項：

各選相關(guān)性熱圖效果如下：

Circle相關(guān)性系數(shù)圖顯示為圓形，形狀大小與顏色深淺為對應(yīng)相關(guān)系數(shù)：

Ellipse相關(guān)性系數(shù)圖顯示為橢圓形，形狀方向代表正負，顏色為對應(yīng)系數(shù)：

Color以顏色深淺表示相關(guān)性系數(shù)大小，得到的圖形與Excel相似：

Number直接以數(shù)字形式顯示相關(guān)性系數(shù)：

Mixed模式上方顯示圓形氣泡，下方顯示對應(yīng)相關(guān)性系數(shù)：

3.2 Layout

設(shè)置包括Lower Triangular Matrix(下三角矩陣)與Upper Triangular Matrix(上三角矩陣)兩個選項：

Lower Triangular Matrix效果如下：

Upper Triangular Matrix效果如下：

3.2 Lable

設(shè)置包括None(無顯示)、Correlation Coefficient(相關(guān)系數(shù))、P-value(P值), Insignificant Mark(無顯著性標志)與Significant Mark(顯著性標志)5個選項：

默認Lable為None(無顯示)。

Correlation Coefficient在氣泡圖的基礎(chǔ)上顯示相關(guān)系數(shù)：

P-value在相關(guān)性熱圖的基礎(chǔ)上顯示P值：

Insignificant Mark在相關(guān)性熱圖上標記無顯著性的兩組，即無相關(guān)性的兩組會有X：

Significant Mark與Insignificant Mark相反，顯示相關(guān)性有顯著性差異的兩組的差異，差異越大星號越多：

大家可以按照需要對Method、Layout與Label參數(shù)進行設(shè)置，導出符合SCI論文發(fā)表要求的高分辨率圖片即可。

擴展

除了Correlation Plot App外還有哪些實用工具可以高效的繪制相關(guān)性熱圖？

4.1 微生信在線生物信息學數(shù)據(jù)可視化。可導出Svg格式的矢量圖，其網(wǎng)址為：http://www.bioinformatics.com.cn/ 。

4.2 聯(lián)川生物在線繪圖網(wǎng)址：http://www.lc-bio.cn/overview 。

今天給大家分享無代碼繪制各種高大上的相關(guān)性熱圖就到此為止了，希望對大家有所幫助，感興趣的小伙伴趕緊去試試吧！

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的origin做相关性分析图_高分文章的相关性热图，十分钟教你学会无代码复现的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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