推荐几个单细胞数据分享和展示平台 | 短视频演示
生活随笔
收集整理的這篇文章主要介紹了
推荐几个单细胞数据分享和展示平台 | 短视频演示
小編覺得挺不錯的,現在分享給大家,幫大家做個參考.
Broad的單細胞數據分享和展示平臺
可選擇子類展示
映射單個基因的顏色到t-SNE/UMAP圖
分屏展示Cluster著色圖和單基因著色圖
多基因熱圖、Dotplot、Boxplot、Violinplot展示
部分圖可導出矢量圖格式
視頻2-4分鐘,都沒有聲音,可直接播放
UCSC single cell browser
細胞t-SNE/Umap圖可按metadata中很多屬性著色
可查找定位關注的細胞、細胞簇
可著色單基因的表達圖
可自定義顏色
可分屏展示2種顏色映射方式
視頻2-4分鐘,都沒有聲音,可直接播放
Cell X Gene
一個Python包,可部署到本地電腦或自己服務器展示
可按多種細胞屬性著色
可繪制2個基因的表達相關性點圖
可按單基因表達著色
可選擇2個簇進行差異基因分析
視頻2-4分鐘,都沒有聲音,可直接播放
ASAP在線單細胞分析平臺
可在線進行單細胞分析
展示功能多出一個三維展示,其它無明顯特色
視頻2-4分鐘,都沒有聲音,可直接播放
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (一)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (二)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (三)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (四)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (五)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (六)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (七)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (八)
哈佛大學單細胞課程|筆記匯總 (九)
往期精品(點擊圖片直達文字對應教程)
機器學習
后臺回復“生信寶典福利第一波”或點擊閱讀原文獲取教程合集
總結
以上是生活随笔為你收集整理的推荐几个单细胞数据分享和展示平台 | 短视频演示的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
- 上一篇: 关于编程学习的一些思考
- 下一篇: WGCNA分析,简单全面的最新教程(在线