作為本科學生物，碩博轉行生物信息的人，經常會被人問起，為啥學習生物信息了呢？這背后通常會帶著一些困惑，生物信息分析好不好學？

生信的作用越來越大，想學的人越來越多，不管是為了以后發展，還是為了解決眼下的問題。但生信學習不是一朝一夕就可以完成的事情，也許你可以很短時間學會一個交互式軟件的操作，卻不能看完程序教學視頻后就直接寫程序。也許你可以跟著一個測序分析流程完成操作，但不懂得背后的原理，不知道什么參數需要修改，結果可以出來，卻把握不住對還是錯。

我讀書的時候，實驗室純計算機出身的人員只占很小比例，更多的是大學期間學生物的；特別的，有個做的挺好的師兄，本科是商科出身。從這來看，像我這樣本科學生物轉行生物信息還不算是有跨度的。這也從一個側面說明，專業背景不是能否學好生信的決定因素。

想想自己大學開始自學生信的時候，可以說是一頭霧水，只知道先學習編程，查了查資料，是要學習perl語言，但是不知道要在什么地方寫，怎么去運行。費了些勁，在windows上安裝好perl，寫個文本文件，改下后綴，發現文件的圖標變成了perl的圖標，雙擊就可以運行了，不會寫命令行參數，不會輸出重定向，一種傻呵呵的體驗。

后來接觸了Linux系統，體驗到在終端輸入命令的快意，才找到了編程的感覺。不過，深深印在腦海里的還是作為一個生信小白的時候，寫一個程序不知道在哪寫，在哪運行。看過不少的教程都默認學習者會打開終端，會使用終端，會在終端運行命令。而我卻是個例外，什么都不會。程序可以照著教程寫下來，卻不知道怎么運行。所以在我后來寫python教程的時候（后臺回復python 可獲取），第一部分就是介紹程序在哪兒寫，在哪兒運行，怎么運行。（最開始學習perl，在研一時在QQ群一個同一大學學長的忽悠下，嘗試了下python，那時有些編程基礎，寒假在家看了遍《python簡明教程》就可以寫了，以后也就習慣了這個語言）。

我個人是個理解能力比較差的，尤其是在接觸新的領域時，閱讀不少教程，總覺得這些教程都是給有些基礎的人寫的，自己去學習時，需要多方嘗試，多多綜合，才能找到門路。為了方便自己學習，也為了記述學習過程，就開始寫博客去記錄，力爭從一個小白的視角、從最基礎的角度去寫作，記述哪怕是最簡單的一步操作，一個錯誤，提供一個近乎人人可以直接上手的教程 （比如虛擬系統Docker的使用教程 -http://blog.genesino.com/2016/07/docker/）和任務流控制管理的Airflow教程 -http://blog.genesino.com/2016/05/airflow/），這些文章被轉載后，在同一平臺相比于同類的教程閱讀量多了10倍，我想這正是因為簡單、可操作，為初學者接觸這些工具提供了最大的便利）。

在初步知道程序語言怎么運行并能成功運行完示例后，就要系統地讀一本簡明教程；簡明的教程不多見，因為一般的教程都涵蓋的面比較廣，而我們初期只需要關注最基本的就好。

（所以我提取了我個人認為比較重要的基礎內容，形成教程），可以找本經典書，請身邊朋友劃下重點，先從頭到尾讀一遍，不管理解多少，然后再讀一遍 。讀不下去，就抄寫一遍。最好的自學方式就是守住一本教材，一遍一遍地去讀去熟悉，每看一遍都會有一些了解，從陌生到熟悉，慢慢就串起來了。然后就開始自己去寫代碼，代碼就是我們思想的體現；我在教人寫代碼時，總會讓他先描述下如果沒有程序，我們自己是如何一步步的手動處理這個問題的，模擬的是程序運行的過程。理清一遍思路之后，怎么想的就怎么寫，只要你敢寫，就成功了。

當然這個時候一般會遇到初學，者經常犯的錯誤，寫完代碼，覺得自己寫的很對，但運行時卻總是提示錯誤，然后總以為是電腦出錯了。而絕大多數情況下，錯誤是我們自己寫作的錯誤；起碼在最開始時，要相信是自己的錯誤，不是程序語言設計的錯誤。錯誤的種類就這么幾種，比如引號未配對、縮進不對、少了空格、文件名不對、變量名字不一致等。這時需仔細看屏幕提示的錯誤信息，在提示的錯誤行附近反復去查看。在之前的python教程和后續的文章中，都有或會提到經常出現的錯誤和解決辦法。

能讓程序提示的錯誤都算不上大的錯誤，而程序運行成功，不等同于程序的邏輯是對的，獲得的結果是對的。程序是我們設計的，多數情況，我們對程序的輸出結果是可以預估和判斷的，不符合預期的結果是我們最應該慎重對待的。

在能獨立寫作程序后，一方面是學以致用，在解決問題中逐步學習；這時谷歌是你最好的幫手，把你遇到的錯誤或想解決的問題的關鍵字提取出，一鍵搜索，可以幫你解決大部分問題。另一方面，則是去學習別人的代碼、學習初學時跳過的內容，利用社區中提供的優秀的模塊或包來簡化、加速自己的操作。入了門，就不需要像剛開始時，什么操作都自己去寫了，俗語叫“自己造輪子”（但自己造輪子是最好的入門方法）；可以用很多經驗更豐富的開發人員做好的輪子解決我們的問題。

學習生信從來就不是一個簡單的事，需要做好持久戰的心理準備。

在學習時，我們都希望由淺入深的逐步深入，不斷地練習和實踐，這就是為什么我們需要一本書，因為書很系統。但生信發展的歷史短于計算機編程的歷史，如果想要一門程序設計的入門數據，每種語言都可以找到幾本。但想要一個囊括生信的書，就有些難了。本身生信跨領域，需要多學科的知識，而其內部又有不少分子，都囊括了太大，包括的少又有些隔靴搔癢的感覺。

我們當時都是零基礎下自學Linux, ?自學Python，自學R，自學高通量測序；這些學習經歷，之前都零星地記錄在博客里。現在回頭去看幾年前自己記錄的東西，覺得好簡單，而當時卻費了很大的力氣。這些零星的隨手記，當時也只是為了自己看，到現在確實只有自己能看得懂，不便惠及更多的人。

因此我們創建了生信寶典，希望從不同的角度傳播知識。這個不同有三點含義，一是形式上的不同，摒棄之前主編們單人作戰想寫啥就寫啥，而是有組織有計劃的內容聚合，提供一系列的教程，由入門到提高。二是內容的不同，不去用網上現有教程的通用數據做例子，而是拿實際生物數據，講述如何解釋生信中普遍碰到的問題，講述如何處理自己的數據。三是立足點不同。在寫作時，我們回到了當年，在回憶中用整個階段的學習去指導當初的那個小白，從那些會了的人覺得微不足道而不會的人又邁不過的坎入手，直擊痛點。知識點的收錄依據不是是否炫酷，是否難，而是是否必要。如果必要，再簡單，也要提及；如果不必要，再炫酷，也暫不納入。

通過大量的生信例子、關鍵的注釋和濃縮的語句形成下面的一系列學習教程。每一篇內容都不多，可以當做小說閱讀，也可以跟著去練，反復幾遍，每讀一次都會有不同的收獲和體會。

PS. 所有圖片來源于新媒體管家插件

總結

以上是生活随笔為你收集整理的知乎阅读三百万的生信学习指南的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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