生物信息分析離不開數(shù)據(jù)資源和數(shù)據(jù)庫(kù)，生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)分類概覽 (第一版)系統(tǒng)梳理了常用功能數(shù)據(jù)庫(kù)。

下面再分析3個(gè)我們承建的NAR發(fā)表的新數(shù)據(jù)庫(kù)，以饗讀者。

中醫(yī)藥方劑的數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄方劑、藥材、靶點(diǎn)、疾病、通路等信息，

網(wǎng)站古色古香，設(shè)計(jì)精美，交互探索，網(wǎng)絡(luò)大氣，

高顏值是很好的敲門磚，

于2018年發(fā)表于NAR雜志。

表格展示太枯燥，關(guān)鍵信息交互式餅圖展示，查看，點(diǎn)擊篩選~~

現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫(kù)升級(jí)第二版，更多功能，更多展示 （網(wǎng)絡(luò)圖比下面這個(gè)更漂亮，更有生物意義，更有交互性，只是暫時(shí)還不能釋放 o(╥﹏╥)o）。

另一個(gè)是`Prophage hunter`，在細(xì)菌基因組中尋找活性噬菌體。

頁(yè)面極簡(jiǎn)，但設(shè)計(jì)精良，定制基因組瀏覽器交互，

于2019年發(fā)表于NAR雜志。

表格和基因組瀏覽器的雙向控制

再一個(gè)是海洋天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)，頁(yè)面精美，功能強(qiáng)大！剛剛發(fā)表于2020年NAR數(shù)據(jù)庫(kù)專刊。

多模式組合檢索

做的更多的還是分子數(shù)據(jù)的展示，如轉(zhuǎn)錄組相關(guān)數(shù)據(jù)的展示。

首先展示下首頁(yè)，專業(yè)設(shè)計(jì)師私人定制，可以傳統(tǒng)，可以現(xiàn)代；可以功能為主，也可以輪播酷炫。

• 首頁(yè)搜索框全局搜索，類似谷歌，輸入基因名、通路名、功能關(guān)鍵詞皆可搜索。

• 小輪播展示網(wǎng)站可做的分析和結(jié)果展示，差異基因富集全套，還是交互式的。

• 四個(gè)餅圖聯(lián)動(dòng)展示數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的樣品和屬性信息，高端大氣顯內(nèi)涵。

那搜索一下，都展示哪些信息？

基因，別名，公共數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接，功能注釋，表達(dá)分布，PPI網(wǎng)絡(luò)，共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，想放啥放啥！

一個(gè)基因嫌少，來(lái)繪制一組基因的表達(dá)譜，修飾譜；同時(shí)展示甲基化修飾與基因表達(dá)的關(guān)系。

圖就不展示了，絕對(duì)心中所想！

搜索太簡(jiǎn)單了（其實(shí)功能很強(qiáng)大），可否更多條件搜索？

多組學(xué)如何展示？基因組瀏覽器可否嵌入？

基因組瀏覽器是多組學(xué)的展示利器，更多見(jiàn)：

• IGV基因組瀏覽器可視化高通量測(cè)序數(shù)據(jù)

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 1

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 2

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 3

ChIP類數(shù)據(jù)同時(shí)展示IP,?Input樣品豐度 （這個(gè)雙峰圖可拆可合）和peak信息，見(jiàn)下圖。

展示同源物種，也可以~

更多在線功能，樣品聚類、篩選、差異基因（樣品特異性基因）、功能富集 （一個(gè)小的云平臺(tái)出來(lái)了）

更多交互式圖，染色體圖譜、餅圖、箱線圖、交互式表

數(shù)據(jù)庫(kù)收錄樣本信息更多互動(dòng)展示

這也是一個(gè)主頁(yè)風(fēng)格，隨您定制。

更多地圖展示

時(shí)間軸變化來(lái)一個(gè)

訪問(wèn)量統(tǒng)計(jì)頁(yè)來(lái)一個(gè) （這是高顏值可定制在線繪圖工具-第三版的用戶訪問(wèn)，總訪問(wèn)量20萬(wàn)，給您做個(gè)友情鏈接，也能推廣帶動(dòng)訪問(wèn)）

以上列出一部分，更多數(shù)據(jù)庫(kù)還在建設(shè)中，發(fā)表后慢慢釋放，更多展示和需求也等您提出。

如果您也有建設(shè)的需求，歡迎聯(lián)系我們。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的分享我们承建的三篇NAR的数据库的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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