这些基因的名字太有才了,研究一下都可以发10分文章
2019/10/03 修改版:這篇剛發的時候,評論里有老師補充了3個fun gene names,這次添加在了文末的表格中。時間一直在走,一個月,六個月,十年,七十年,仿佛過了很多年,感覺卻只有一瞬間,新關注的朋友很多,所以想著做個“舊文新看 ”,之后也會有類似文章,歡迎各位評論,分享想法。
作為一個人的代號,名字既可以像朱元璋一樣突顯自我,也可以像朱重八一樣只是父母年齡疊加,基因名類似。雖然在生物研究尤其是基因項目中不斷有許多新基因出現,但研究歷史可以追溯到孟德爾時期的基因直到1905年才正式有了gene的術語。為了更好的研究和描述基因的功能,基因名的確定一直為人津津樂道——一般遵從先發現先命名,由發現者決定,之后可能由各種緣由加成確定。
現在的基因名通常聯系一些突變表型,例如基因Callipyge(雙臀肌基因),在綿羊中發生突變的話,病變體臀部會變得肌肉結實,但也有僅描述實驗相關的名字,比如nBAF 45和BAF 47反映的是產品分子量的變化。另外,基因名大致可以分為四大類和十一子類。具體如圖:
描述如下:
M類:明確反映基因的潛在特征,有三個子集。
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M-scientific:這是一個描述內容最仔細的子類。雖然有時會出現奇怪的簡寫,但是本體意義一眼明了,比如熒光素酶-Luciferase(LRE),光產生器的生物成分名都有合起來是lucife的根,在拉丁語中是“光明使者”的意思,因此不難理解LRE。
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M-literal: 用通感、比喻等文學性語言修飾基因特性。例如基因Sonic Hedgehog(SHH)編碼產生Sonic hedgehog(Shh)分泌蛋白,介導脊索和底肋板之間信號傳導活動,從而導致蒼蠅胚胎病變,并長出類似棘刺的東西,和刺猬相像,而Sonic(競速游戲 刺猬索尼克)作為刺猬界的大佬在這里出現似乎合情合理。
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M-embed: 和M-literal一樣會采用類文學語言,但會相對嵌上一些流行文化、歷史或者文學因素,比如Spock基因發生突變時斑馬魚的內耳會變成梨形,正像了星際迷航中的瓦肯星人,而強大的“混血”人Spock數年來一直為人追捧,出現這個名字是絕對的真實追星現場。
~M類:擁有三個大類并且名字完全不傳達基因個體本身信息,發生這種現象的原因多種多樣。
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~M-nr:名字與基因潛在作用沒有任何相關性,來源多是生物學家們的奇思妙想。例如果蠅的yippee基因其實是根據一個研究生對克隆這個基因的自然反應得到的。(yippee開心的意思,克隆出新基因,很高興的事情)
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~M-irrel:這個類別的名字縮寫呈現難以言喻的笑果(雖然和突變特征沒有絲毫關系),比如上圖中的基因RING(a really interesting new gene),它的結構域是鋅指類型的蛋白質結構域,而許多含有RING finger的蛋白質在泛素化途徑中起著相當關鍵的作用,起這個名的人大概覺得這真的很有趣。(不過從另外一個角度,鋅指蛋白的結構也像一枚戒子)
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~M-outside:由于外界施壓重生的名字,比如POKEMON(POK Erythroid Myeloid Ontogenic factor),是一種其他癌基因引發癌癥必需的癌轉換基因,但是有著Pokémon(寵物小精靈)特許經營權的任天堂不希望與癌癥相關,因此現在已經變成了無聊的Zbtb7。
T類:多基因的命名轉變到其他領域
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T-relation:除了保留名稱之間的內部關系,特征關系也經由整個系統傳達出來,尤其是還通過了轉換系統內指定的名稱實現,例如Grim and Reaper(死神)兩個基因相互作用時會減短蒼蠅的生命周期。
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T-norelation:名稱之間的任何內部關系在應用于基因時丟失,且名字的含義僅和整個轉換系統相關。
P類:P類有三個子集且和多基因命名相關,在樣本規模大的生物命名法中很容易出現問題。**
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P-clash:發生在屬于同系物但名字相互沒有關系的基因間,比如基因PKD 1(人)和基因LOV-1(蠕蟲)是同系物,基因相似但名稱之間完全沒有關系。
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P-confusion:不同基因具有相同名稱或者一個基因有多個名字都會讓人混淆,例如jolly基因(全名:腫瘤壞死因子受體亞家族,成員1B)又稱TNFR2、TNFBR、TNFR-75kD、TNFR-80 kD、p75TNFR、p75和CD120b。
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P-defunct:名字對應的功能或特征被證實不符或容易產生誤導。如 對應老鼠中同一基因的BAF45和BAF47,現在因為對產品分子量的矛盾估計已經改叫Ini 1。
通過上面的基因名分類不難發現單基因名由于和實意聯系更容易產生趣味,這些歸功于科學家的幽默無與倫比,看看這些圖能猜到對應的基因名字嗎?
圖1
圖2
圖3
圖4
圖5
圖6
圖7
圖8
對于其他的fun gene names?還有著以下介紹,讓我們一起看看還有哪些驚艷的基因名:
| Boss gene (Bride Of Sevenless) | 是果蠅復眼中R7細胞發育必須的蛋白Sevenless的配體,Boss因與其結合而得名。“夫妻”合作的結果是蒼蠅視網膜上R8光受體神經元可以誘導相鄰細胞并通過細胞接觸呈現R7細胞命運。 | |
| Brainiac(動畫片Pinky and the Brain里的聰明老鼠Brain) | 果蠅的這條基因變異會使得腦部發達,正可以解釋遺傳性大頭 | |
| Cabernet, Chardonnay, and Riesling(紅葡萄酒,白葡萄酒,干白葡萄酒中的三種品牌) | 斑馬魚含這三種任意基因的話,血細胞量會低于正常值且顏色也會與酒的顏色映襯 | |
| Da | 擬南芥中控制植物種子和器官大小的基因。(跟我一起讀:大) | |
| Dracula(吸血鬼德古拉) | 斑馬魚中的突變體會對光敏感,暴露在光線下會出現幾種影響皮膚和內臟器官的遺傳性疾病的癥狀。見光死的特性類似傳說中的吸血鬼 | 圖一 |
| Hamlet | 影響果蠅 IIB細胞后代細胞的發育,是決定了“To be or not to be‘’的基因界哈姆萊特。 | |
| hu-li tai shao (hts) | (跟我一起讀:護理太少, too little nursing) 和果蠅卵母細胞中ring canal的形成有關,控制或編碼肌動蛋白結合蛋白的基因。 | |
| Indy (I’m Not Dead Yet) | 其功能與Kreb cycle的中間代謝產物之運送有關,最開始的研究發現其突變體有更長的壽命,因此得此名。后來又有研究不太支持這一結論 | |
| Jordan element | 邁克爾喬丹,因為它具有跳躍簡單植物-團藻的基因組的非凡能力。 | |
| Ken and Barbie(肯和芭比娃娃) | 該基因調節果蠅外生殖器發育,發生突變的果蠅沒有外生殖器,而關于芭比娃娃,只能說這想象力也沒誰了 | |
| LEUNIG和 SEUSS | 以漫畫家LEUNIG(用漫畫諷刺過澳洲的兒童保育服務,作品探索精神和宗教信仰,帶有一定政治色彩)和SEUSS(兒童文學作家,政治漫畫家)命名的兩個擬南芥基因,大概兩人都對兒童發展有所影響,而這兩基因恰好共同作用調節花的發育 | |
| Maggie | 突變后發育停滯,像the Simpsons中十五年如一日的Maggie。(腦洞下如果取名字的是日漫迷得話大概得叫“Conan” | 圖二 |
| PENNYWISE | 以加州朋克搖滾樂隊命名的擬南芥基因,和POUND-FOOLISH基因一起發揮作用 | |
| Superman | 擬南芥基因,突變失活后花長出額外的雄蕊。Clark Kent是中等程度superman突變,Kryptonite抑制superman的功能。在DC漫畫中, superman和Clark kent都是超人,Kryptonite氪石,一種綠色結晶物質,可使超人衰弱和生病。 | 圖三 |
| Swiss Cheese | 突變體大腦中有洞,像瑞士奶酪! | 圖六 |
| Tinman | 突變體果蠅無心臟,來源于綠野仙蹤中的Tin man鐵皮人,缺少心臟 | 圖四 |
| Van Gogh(梵高) | 發生在兩個基因中的突變,突變成年果蠅的翅膀紋路兩極發展且形狀類漩渦,圖案就像梵高的《星夜》 | 圖五 |
| Wukong, Wujin, Wuneng | (跟我一起讀:悟空、悟凈、悟能)黃熱病蚊子中的轉座子元件,是微型反向重復轉座元件,可能與調控基因的進化有關。 | |
| hERG (the human Ether-à-go-go-Related Gene) | 該基因突變的果蠅在乙醚麻醉處理后,它們的腿就開始顫抖,就像當時流行的威士忌搖擺舞(Whisky A Go-Go) | |
| huluwa | 該基因定位于斑馬魚基因組第21號染色體,是一個母系來源的跨膜蛋白,可通過穩定β-catenin信號誘導脊椎動物胚胎背側組織中心和體軸的形成,發生突變的斑馬魚突變體呈“葫蘆”形狀,是“葫蘆娃”本娃沒錯 | 圖七 |
| MHZ基因 | 該基因對應于水稻乙烯反應突變體“mao hu zi ”,名字大概起源于“Ma He Zhang ”(該突變體由中科院遺傳發育所張勁松課題組的馬彪老師摸索篩選得到),而想到“貓胡子”這樣的名字,大概兩位學者可能也是MHZ(萌漢子) | 圖八 |
還有哪些有趣的基因名字,歡迎留言討論。
總結
以上是生活随笔為你收集整理的这些基因的名字太有才了,研究一下都可以发10分文章的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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