聚類熱圖根據(jù)不同的聚類算法和距離計(jì)算方式，獲得的熱圖分支結(jié)構(gòu)會(huì)有一些不同。有時(shí)，我們也希望能在不改變分支結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，對(duì)熱圖分支的順序進(jìn)行一些調(diào)整，這就是推文聚類熱圖怎么按自己的意愿調(diào)整分支的順序？的出發(fā)點(diǎn)。

現(xiàn)在這個(gè)功能也搬到了BIC平臺(tái)，具體怎么做呢？

采用之前的繪圖數(shù)據(jù)

采用默認(rèn)的繪圖參數(shù)

出來一個(gè)熱圖，看著還不錯(cuò)

現(xiàn)在我們想調(diào)整下列的順序，習(xí)慣上對(duì)照組在前，處理組在后，我們加一列權(quán)重信息，在不影響層級(jí)聚類結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 （層級(jí)聚類中，哪兩個(gè)/兩組樣品在同一分支下是不可以改變的，但同一分支下的兩個(gè)/兩組樣品誰在左、誰在右是沒關(guān)系的），權(quán)重大的列排在左側(cè)，權(quán)重小的列排在右側(cè)。

在colWright列下，加了權(quán)重信息。

ID conditions individual SV1 ColWeight untrt_N61311 untrt N61311 -0.101 80 untrt_N052611 untrt N052611 0.018 100 untrt_N080611 untrt N080611 -0.429 70 untrt_N061011 untrt N061011 0.535 90 trt_N61311 trt N61311 -0.125 40 trt_N052611 trt N052611 0.036 60 trt_N080611 trt N080611 -0.467 70 trt_N061011 trt N061011 0.533 50

我們希望排序順序?yàn)?

untrt_N052611 untrt_N061011 untrt_N61311 untrt_N080611 trt_N080611 trt_N052611 trt_N061011 trt_N61311

拷貝數(shù)據(jù)、設(shè)置參數(shù)，主要是

Column used for reorder row cluster branches: 選擇哪一列作為行聚類排序的權(quán)重列

Column used for reorder column cluster branches：

選擇哪一列作為列聚類排序的權(quán)重列

Exclude order variable from row annotation：

這一列有時(shí)是自己編的值，只是拿來美化圖，而不希望展示，可以通過該參數(shù)隱去

Exclude order variable from column annotation：

這一列有時(shí)是自己編的值，只是拿來美化圖，而不希望展示，可以通過該參數(shù)隱去

提交后獲得結(jié)果，順序如我們期望。

調(diào)整時(shí)如果未達(dá)到預(yù)期效果，首先看下是不是你想要的順序改變了分支結(jié)構(gòu)；如果沒有改變結(jié)構(gòu)但卻依然無效果，則可以嘗試加大不同樣品權(quán)重的差距，獲得預(yù)期的排序效果。

這是其中一種調(diào)整分支順序的方式，在文章聚類熱圖怎么按自己的意愿調(diào)整分支的順序？還提供了很多種其它排序方式可供參考和使用。

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總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的无代码调整聚类热图分支顺序的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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