花器官身份基因与靶基因间的调控进化情况
植物花器官的類型(如萼片、花瓣、雄蕊和心皮等)有限,但在大小、形狀、結構和顏色等方面表現出豐富的多樣性。鑒定和比較不同物種中花器官身份基因的靶基因,是理解花器官共性和特性形成分子機制的關鍵。然而,由于現有的研究僅限于少數幾個物種,花器官身份基因與靶基因間調控進化的整體情況尚不清楚。
中科院植物所孔宏智研究組與徐桂霞研究組合作,以毛茛科藍花耬斗菜(Aquilegia coerulea)為材料,利用ChIP-seq技術和生物信息學方法,鑒定了花瓣身份基因AqAP3-3的靶基因。研究發現:
AqAP3-3在基因組上結合的保守序列(基序)為CArG box類型,多數位于靶基因啟動子區;
AqAP3-3與擬南芥AP3共享的靶基因是進化上高度保守的靶基因,主要決定花瓣身份相關的性狀;
進化上不保守的靶基因大多參與特有性狀的形成,如藍花耬斗菜的距、蜜腺、表皮毛和花瓣顏色等。
這些結果說明花瓣身份基因在不同物種中對已有調控網絡的招募或新調控關系的建立,是花瓣形態結構多樣化的主要原因。該研究結果不僅是理解花瓣共性和特性的基礎,而且為研究花器官身份基因與靶基因間的調控進化提供了新思路。
該研究成果于近日在線發表于著名國際學術期刊New Phytologist上。植物所已畢業博士生蔣永超、助理研究員張睿和博士生王美美為本文共同第一作者,徐桂霞研究員和孔宏智研究員為共同通訊作者。該研究得到了國家自然科學基金項目和中國科學院項目的資助。
文章鏈接:https://doi.org/10.1111/nph.16601
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藍花耬斗菜的花及本研究的流程圖?
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AqAP3-3和AP3靶基因的比較?
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總結
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