寫作排版必備

NGS系列文章包括NGS基礎(chǔ)、轉(zhuǎn)錄組分析?（Nature重磅綜述|關(guān)于RNA-seq你想知道的全在這）、ChIP-seq分析?（ChIP-seq基本分析流程）、單細(xì)胞測(cè)序分析?(重磅綜述：三萬(wàn)字長(zhǎng)文讀懂單細(xì)胞RNA測(cè)序分析的最佳實(shí)踐教程 （原理、代碼和評(píng)述）)、DNA甲基化分析、重測(cè)序分析、GEO數(shù)據(jù)挖掘（典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - Limma差異分析、火山圖、功能富集）等內(nèi)容。

Markdeep: 文檔書(shū)寫展示兩不誤

Markdown是一種輕量級(jí)標(biāo)記語(yǔ)言，允許人們使用易讀易寫的純文本格式編寫文檔（別人的電子書(shū)，你的電子書(shū)，都在bookdown）。手頭只要有一個(gè)文本編輯器，不管是在筆記本還是在服務(wù)器都可以自由寫作（Linux - VIM的強(qiáng)大文本處理方法）。而且由于是純文本文件，可以方便使用Git管理（Windows輕松實(shí)現(xiàn)linux shell環(huán)境：gitforwindows）。

寫作是方便了（英語(yǔ)寫作常見(jiàn)錯(cuò)誤總結(jié)和學(xué)習(xí)視頻），但呈現(xiàn)給別人看時(shí)不免就有些麻煩，需要一些支持Markdown的編輯器或轉(zhuǎn)換工具進(jìn)行轉(zhuǎn)換，重要的是不方便回轉(zhuǎn)。發(fā)給別人的Markdown腳步看著不舒服，轉(zhuǎn)換后看著舒服，修改又不方便了。

現(xiàn)在，有了一個(gè)工具M(jìn)arkdeep(一段JavaScript代碼，起始寫于2015年，一直維護(hù)升級(jí)至今)，使得我們只要在寫作的Markdown文檔中引用下這段代碼（就是簡(jiǎn)單的在文件末尾加一句話）就可以輕松實(shí)現(xiàn)Markdown和網(wǎng)頁(yè)的互轉(zhuǎn)。

其支持的特性也比較多，常見(jiàn)的Markdown標(biāo)題等級(jí)、代碼高亮、引用、列表、表格等，還支持一些新的功能，簡(jiǎn)單列舉幾個(gè)：

直接嵌入多種形式的流程圖，如ASCII流程圖 （中文支持不好）和gravizo流程圖，支持。

支持自動(dòng)生成目錄（層級(jí)少時(shí)不生成目錄，層級(jí)多時(shí)生成目錄）。

支持嵌入Base64格式的圖形，解決Markdown圖形引用的問(wèn)題。

支持引用其它Markdown文件，方便大文件拆分成多個(gè)寫作。

（3）和（4）結(jié)合起來(lái)可以很好的處理圖形引用問(wèn)題，每個(gè)圖形的Base64單獨(dú)放一個(gè)文件，在主文檔引用展示。

支持嵌入Latex公式（萬(wàn)能轉(zhuǎn)換：R圖和統(tǒng)計(jì)表轉(zhuǎn)成發(fā)表級(jí)的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量圖等）。

支持嵌入視頻。

Markdown格式和HTML格式輕松轉(zhuǎn)換。

也可以很方便的導(dǎo)出成PDF。

更多功能按需獲取，具體使用請(qǐng)看公眾號(hào)里的視頻。

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的只需一行代码，完美呈现Markdown格式，写作展示两不误的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

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