玉米转座子插入型突变体”五折优惠
“玉米轉座子插入型突變體”五折優惠
一年一度的雙十一來啦!中國農業科學院作物科學研究所重大平臺中心隆重推出“玉米轉座子插入型突變體”5折優惠活動!即日起至12月15日,凡訂購“玉米轉座子插入型突變體”,即享原價3000元/份,現價1500元/份的優惠,欲購從速!
聯系方式:
中國農業科學院作物科學研究所 孫老師
18645149460
突變體介紹
突變體是植物功能基因組學研究的基礎材料,轉座子作為一類可移動的DNA元件,在植物突變體庫的構建中被廣泛應用。近期,來自中國農業科學院作物科學研究所、河南農業大學、中國農業科學院生物技術研究所的合作團隊,利用W22株系中天然存在的活化Ac轉座酶在K17株系背景中激活Ds轉座子,并在后代中純化了遺傳穩定的Ds插入型突變體庫。使用自主研發的TEA-seq技術,合作團隊在全基因組范圍高效測序鑒定了突變體單株內的Ds基因組插入位點信息。
該突變體庫具有如下特點:
K17/昌7-2優勢自交系遺傳背景,具備優良農藝性狀
全基因組鑒定到70600個非重復的Ds插入位點
在15852個基因區含有插入突變,覆蓋了約36%的玉米基因
轉座子攜帶剪切識別序列和終止密碼子,可造成基因失活
不涉及轉基因過程,后續科研和育種研究可按常規自交系管理
結合BSA/BSR技術可高效正向定位關鍵調控基因
玉米Ds插入突變體庫的鑒定為玉米功能基因組學研究提供了重要的材料資源,相關突變體和突變信息可在MEILAM數據庫進行查詢,詳情見:http://www.maizetepolymorphism.com/AcDs/?
應用案例一:重要調控基因的生物學功能論證
玉米重要馴化相關基因Teosinte Branched 1(TB1)調控側枝發育。我們鑒定到了一個新的等位突變事件,突變體tb1上游411bp處發生Ds轉座子插入,qRT-PCR驗證該基因表達量下降。突變體產生側枝發育增加和多穗表型。INCW3與細胞壁發育有關在籽粒中表達,我們鑒定到一個新的等位突變事件,突變體incw3的第二外顯子發生了Ds插入,造成基因結構破壞。突變體產生種子皺縮表型。
應用案例二:重要農藝性狀調控基因的高效正向定位
我們發現一個突變體具有籽粒皺縮表型,且果穗上飽滿與皺縮種子的表型分離比例接近3:1。選擇兩類表型種子各20粒,發芽后取樣建立BSR/BSA混池文庫并進行測序,定位到3號染色體存在顯著的關聯峰。該區域中唯一的Ds插入事件發生在一個AGAMOUS-like 2轉錄因子的基因編碼區域。該基因為印記修飾基因并在籽粒中高度特異表達。綜上證據,可考慮認為AGL2是玉米籽粒發育過程中的一個新的調控基因,受DNA甲基化特異調控,其受表觀遺傳學修飾調控過程及下游轉錄調控網絡需要進一步研究。
注:中國農業科學院作物科學研究所劉君、程溪柳、呂明杰、付俊杰、劉遠航、劉小溪等負責實驗設計、儀器設計、鑒定工具和在線數據庫開發、生化實驗流程開發、生物信息學分析,河南農業大學陳彥惠、庫麗霞、柳華峰等負責玉米突變體庫構建、株系純化、K17基因組組裝,中國農業科學院生物技術研究所王歡、Joram Kiriga Waititu、孫瑩等負責儀器設計、生物信息學分析和驗證實驗。相關工作得到科技部十三五重點研發,國家自然科學基金,中國農業科學院創新工程等資助。
參考文獻
1.論文:Mingjie Lyu,Huafeng Liu,Joram Kiriga Waititu,Ying Sun, Huan Wang, Junjie Fu, Yanhui Chen,Jun Liu, Lixia Ku,Xiliu Cheng, TEAseq-based identification of 35,696 Dissociation insertional mutations facilitates functional genomic studies in maize, Journal of Genetics and Genomics, 2021, S1673-8527 (21) 00227-7, https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.010
2.專利:一種高通量快速磁珠法提取植物基因組DNA的試劑盒及提取方法,202010940039.7
3.專利:一種底部側吸式磁力架,ZL202021917582.7
4.專利:一種基于NGS測序的AcDs全基因組位點高效檢測引物和方法,202011139059.0
5.專利:一種便攜式96孔超順納米磁珠操作儀,ZL202021400342.X
6.專利:一種基于磁珠法的高通量便攜式核酸提取儀, 202010684707.4
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總結
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