生物信息分析離不開數(shù)據(jù)資源和數(shù)據(jù)庫，生物信息學數(shù)據(jù)庫分類概覽 (第一版)系統(tǒng)梳理了常用功能數(shù)據(jù)庫。

下面再分析5個我們承建發(fā)表的數(shù)據(jù)庫，3篇NAR，一篇BIB，一篇Nature protocols，總計影響因子71，以饗讀者。

中醫(yī)藥方劑的數(shù)據(jù)庫，收錄方劑、藥材、靶點、疾病、通路等信息，

網(wǎng)站古色古香，設計精美，交互探索，網(wǎng)絡大氣，

高顏值是很好的敲門磚，

于2018年發(fā)表于NAR雜志。

表格展示太枯燥，關鍵信息交互式餅圖展示，查看，點擊篩選~~

現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫升級第二版，更多功能，更多展示 （網(wǎng)絡圖比下面這個更漂亮，更有生物意義，更有交互性，只是暫時還不能釋放 o(╥﹏╥)o），第三版也在進行投稿中。

另一個是`Prophage hunter`，在細菌基因組中尋找活性噬菌體。

頁面極簡，但設計精良，定制基因組瀏覽器交互，

于2019年發(fā)表于NAR雜志。

表格和基因組瀏覽器的雙向控制

再一個是海洋天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫，頁面精美，功能強大！發(fā)表于2020年NAR數(shù)據(jù)庫?？?。

多模式組合檢索

高通量分離培養(yǎng)和鑒定植物根系細菌的在線分析平臺于2021年發(fā)表于Nature Protocol。

做的更多的還是分子數(shù)據(jù)的展示，如轉錄組相關數(shù)據(jù)的展示，發(fā)表于BIB雜志。

首先展示下首頁，專業(yè)設計師私人定制，可以傳統(tǒng)，可以現(xiàn)代；可以功能為主，也可以輪播酷炫。

• 首頁搜索框全局搜索，類似谷歌，輸入基因名、通路名、功能關鍵詞皆可搜索。

• 小輪播展示網(wǎng)站可做的分析和結果展示，差異基因富集全套，還是交互式的。

• 四個餅圖聯(lián)動展示數(shù)據(jù)庫收錄的樣品和屬性信息，高端大氣顯內(nèi)涵。

那搜索一下，都展示哪些信息？

基因，別名，公共數(shù)據(jù)庫鏈接，功能注釋，表達分布，PPI網(wǎng)絡，共表達網(wǎng)絡，想放啥放啥！

一個基因嫌少，來繪制一組基因的表達譜，修飾譜；同時展示甲基化修飾與基因表達的關系。

圖就不展示了，絕對心中所想！

搜索太簡單了（其實功能很強大），可否更多條件搜索？

多組學如何展示？基因組瀏覽器可否嵌入？

基因組瀏覽器是多組學的展示利器，更多見：

• IGV基因組瀏覽器可視化高通量測序數(shù)據(jù)

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 1

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 2

• 高通量數(shù)據(jù)分析必備-基因組瀏覽器使用介紹 - 3

ChIP類數(shù)據(jù)同時展示IP,?Input樣品豐度 （這個雙峰圖可拆可合）和peak信息，見下圖。

展示同源物種，也可以~

更多在線功能，樣品聚類、篩選、差異基因（樣品特異性基因）、功能富集 （一個小的云平臺出來了）

更多交互式圖，染色體圖譜、餅圖、箱線圖、交互式表

數(shù)據(jù)庫收錄樣本信息更多互動展示

這也是一個主頁風格，隨您定制。

更多地圖展示

時間軸變化來一個

訪問量統(tǒng)計頁來一個 （這是高顏值可定制在線繪圖工具-第三版的用戶訪問，總訪問量20萬，給您做個友情鏈接，也能推廣帶動訪問）

以上列出一部分，更多數(shù)據(jù)庫還在建設中，發(fā)表后慢慢釋放，更多展示和需求也等您提出。

如果您也有建設的需求，歡迎掃碼聯(lián)系我們。

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創(chuàng)作挑戰(zhàn)賽新人創(chuàng)作獎勵來咯，堅持創(chuàng)作打卡瓜分現(xiàn)金大獎

總結

以上是生活随笔為你收集整理的生物大数据时代，如何做好数据管理和再利用，发IF10+的数据库文章？的全部內(nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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