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MadFS：高性能超算緩存文件系統(tǒng)

陳康,?武永衛(wèi),?鄭緯民

論文引用格式：

陳康, 武永衛(wèi), 鄭緯民. MadFS：高性能超算緩存文件系統(tǒng)[J]. 大數(shù)據(jù), 2021, 7(3): 150-152.

CHEN K,WU Y W, ZHENG W M.MadFS: a high performance burst buffer file system[J]. Big Data Research, 2021, 7(3): 150-152.

對于存儲系統(tǒng)來說，信息資源的爆炸性增長在I/O支持應(yīng)用的性能以及數(shù)據(jù)可用性等方面提出了越來越高的要求。可以預(yù)見，人工智能、大數(shù)據(jù)和圖計算等新型計算模式對存儲系統(tǒng)的I/O性能更是提出了極致要求。從技術(shù)發(fā)展趨勢上來看，新型的網(wǎng)絡(luò)傳輸硬件及使用模式、新型存儲硬件都提供了極高的訪問帶寬和極低的訪問時延，這一發(fā)展趨勢導(dǎo)致現(xiàn)有的存儲軟件成為性能瓶頸。特別是在提供低時延訪問上，存儲軟件的結(jié)構(gòu)需要進(jìn)行革新。

傳統(tǒng)的分布式文件系統(tǒng)結(jié)構(gòu)按照擴(kuò)展的方式來看，主要有兩個發(fā)展思路。一個是先對磁盤進(jìn)行擴(kuò)展，之后在擴(kuò)展的磁盤基礎(chǔ)上建立文件系統(tǒng)，提供服務(wù)。這個方面的典型是Petal磁盤擴(kuò)展服務(wù)以及Frangipani文件系統(tǒng)。在高性能文件系統(tǒng)中，這個方面的典型是IBM公司的通用并行文件系統(tǒng)（general parallel file system，GPFS）。另外一個發(fā)展思路是直接對文件系統(tǒng)進(jìn)行擴(kuò)展，由一個或者少數(shù)幾個節(jié)點來保存元數(shù)據(jù)，記錄文件數(shù)據(jù)的分布情況，其他的節(jié)點用來保存數(shù)據(jù)。這方面的典型是Google文件系統(tǒng)（Google file system）以及衍生的Hadoop分布式文件系統(tǒng)（Hadoop distributed file system，HDFS）。在高性能文件系統(tǒng)中，采用該思路的是大部分高性能計算機(jī)標(biāo)配的Lustre文件系統(tǒng)。傳統(tǒng)的高性能文件系統(tǒng)在構(gòu)造時大部分將磁盤作為數(shù)據(jù)的存儲介質(zhì)。但是，現(xiàn)有的文件系統(tǒng)不能滿足新一代的人工智能、大數(shù)據(jù)、機(jī)器學(xué)習(xí)等的應(yīng)用，對于新的存儲體系結(jié)構(gòu)、新的網(wǎng)絡(luò)體系結(jié)構(gòu)帶來的高帶寬、低時延的性能優(yōu)勢也缺乏考慮。

在當(dāng)前數(shù)據(jù)密集型計算普及發(fā)展的時代，存儲軟件的訪問性能直接制約了數(shù)據(jù)密集型計算的性能。下一代的存儲系統(tǒng)剛剛開始起步，包括Intel分布式異步對象存儲（distributed asynchronous object storage，DAOS）在內(nèi)的新型存儲結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)正在形成。為了適應(yīng)這種趨勢，清華大學(xué)計算機(jī)系的E級計算機(jī)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)研究團(tuán)隊構(gòu)建了下一代的分布式存儲系統(tǒng)——MadFS，從分布式文件系統(tǒng)軟件的架構(gòu)上進(jìn)行革新，消除現(xiàn)有存儲架構(gòu)的系統(tǒng)性問題，充分釋放硬件的性能，滿足下一代應(yīng)用對數(shù)據(jù)快速處理的需求。MadFS的設(shè)計以性能為第一原則，利用高速遠(yuǎn)程直接內(nèi)存訪問（remote direct memory access， RDMA）網(wǎng)絡(luò)和NVMe SSD存儲設(shè)備，將數(shù)據(jù)快速分散到存儲節(jié)點上進(jìn)行持久化，達(dá)到高吞吐、低時延、高性能的特性。

MadFS的系統(tǒng)架構(gòu)設(shè)計遵循了以下3個關(guān)鍵的設(shè)計原則。

● 數(shù)據(jù)塊和元數(shù)據(jù)的全分散存儲：傳統(tǒng)并行或者分布式文件系統(tǒng)一般使用少量節(jié)點管理元數(shù)據(jù)，導(dǎo)致元數(shù)據(jù)節(jié)點成為整個系統(tǒng)的性能瓶頸。下一代分布式存儲系統(tǒng)MadFS將元數(shù)據(jù)分散到全部節(jié)點上，以避免元數(shù)據(jù)的性能瓶頸，同時數(shù)據(jù)塊也需要分散在全部節(jié)點上。

● 建立內(nèi)核旁路，避免操作系統(tǒng)切換開銷：為了提高系統(tǒng)的性能，MadFS采用避免應(yīng)用程序頻繁進(jìn)入操作系統(tǒng)內(nèi)核的方式來降低上下文切換的開銷。隨著I/O設(shè)備性能的不斷提高，操作系統(tǒng)進(jìn)出內(nèi)核切換的開銷日益突出，MadFS使用用戶態(tài)驅(qū)動、協(xié)議棧等方式直接控制設(shè)備。在對應(yīng)用程序的支持上使用系統(tǒng)調(diào)用截獲技術(shù)，直接在用戶態(tài)處理應(yīng)用的I/O請求，避免其進(jìn)入內(nèi)核。

● 語言級協(xié)程機(jī)制與零拷貝序列化：MadFS利用Rust語言內(nèi)建的異步協(xié)程機(jī)制、零拷貝序列化技術(shù)實現(xiàn)了極低開銷的任務(wù)切換和遠(yuǎn)程函數(shù)調(diào)用。高性能存儲系統(tǒng)常采用異步的方式處理I/O請求，這會給編程引入很大的復(fù)雜性。而新型編程語言Rust提供了利用協(xié)程處理異步邏輯的語言機(jī)制，可以極大地降低異步編程的復(fù)雜性，同時保持極低的任務(wù)切換開銷，保證整體的高性能。

2020年11月19日，由清華大學(xué)計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系存儲系統(tǒng)研發(fā)團(tuán)隊研發(fā)的超算緩存文件系統(tǒng)MadFS在鵬城實驗室“鵬城云腦Ⅱ”的IO500測試中，分別以7 043.99分和1 129.75分同時獲得全球IO500總榜第一名與10節(jié)點榜單第一名，這是國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)首次奪得該排行榜榜首。“鵬城云腦Ⅱ”是一臺基于華為鯤鵬920架構(gòu)的高性能計算系統(tǒng)，于2020年10月開始試運行。本次“鵬城云腦Ⅱ”的存儲系統(tǒng)基于MadFS，針對“鵬城云腦Ⅱ”的硬件特征，采用了基于Rust的高可擴(kuò)展并發(fā)訪問、大粒度數(shù)據(jù)緩存/旁路訪問、數(shù)據(jù)訪問/落盤流水化、零拷貝極速遠(yuǎn)程過程調(diào)用（remote procedure call，RPC）處理技術(shù)等創(chuàng)新優(yōu)化方法。

IO500是高性能計算領(lǐng)域針對存儲性能評測的全球排行榜，是高性能計算領(lǐng)域權(quán)威的榜單之一。IO500測試包括數(shù)據(jù)帶寬BW（GiB/s）和元數(shù)據(jù)性能MD （kIOPS）兩大部分，各項分?jǐn)?shù)取幾何平均后得到總分。在高性能計算領(lǐng)域，不僅CPU算力非常重要，I/O系統(tǒng)的數(shù)據(jù)傳輸更是瓶頸。自2017年11月開始，每年IO500榜單會在高性能計算領(lǐng)域的會議——全球超級計算大會（SC）和國際超級計算大會（International Supercomputing Conference）上發(fā)布。

作者簡介

陳康（1976-），男，清華大學(xué)計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系研究員，主要研究方向為分布式系統(tǒng)、存儲系統(tǒng)等。

武永衛(wèi)（1974-），男，清華大學(xué)計算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系教授，中國計算機(jī)學(xué)會（CCF）高級會員，主要研究方向為并行和分布式處理、云計算和存儲等。

鄭緯民（1946-），男，中國工程院院士，清華大學(xué)計算機(jī)系教授，CCF原理事長，何梁何利基金科學(xué)與技術(shù)進(jìn)步獎獲得者，中國存儲終身成就獎獲得者，《大數(shù)據(jù)》期刊主編。長期從事計算機(jī)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、大規(guī)模數(shù)據(jù)存儲、高性能計算等領(lǐng)域的科研教學(xué)工作。獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎一等獎1次，獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎二等獎2次，獲國家技術(shù)發(fā)明獎二等獎1次。

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總結(jié)

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