|撰文：莫北

在之前一文中《如何用Gephi繪制漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖》一文中，為大家介紹過(guò)如何繪制下圖這樣好看的網(wǎng)絡(luò)圖。

基迪奧生物：生物信息工具 | 如何用Gephi繪制漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖？?zhuanlan.zhihu.com

不過(guò)有好學(xué)的小伙伴就問(wèn)啦，Gephi軟件中并沒(méi)有找到圖例相關(guān)的功能設(shè)置，那么下面的網(wǎng)絡(luò)圖的圖例是如何添加的呢？

（Isme Journal, 2012）

其實(shí)，方法和《如何“偷走”大牛文章漂亮的配色？》介紹的如何提取配色相似，用Ai(Adobe illustrator) 就可以輕松完成。

下面就該文的網(wǎng)絡(luò)圖為例，一起看下如何操作吧。

1.截取分組信息

首先，打開(kāi)Gephi軟件的顏色映射設(shè)置窗口，在Partition選項(xiàng)下查看不同顏色對(duì)應(yīng)taxonomy列物種分類(lèi)數(shù)據(jù)，比如這里的第一個(gè)藍(lán)色表示Proteobacteria（變形菌門(mén)）、第二個(gè)綠色表示Acidobacteria（酸桿菌門(mén)，第三個(gè)橙紅色表示Chloroflexi（綠彎菌門(mén)）等。

然后只需把下圖所示的虛線區(qū)域截圖即可。

接著，把網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)出成PDF或SVG格式的矢量圖，為了方便查看，我這里導(dǎo)出PDF格式。

2.提取分組配色

使用Ai打開(kāi)上一步導(dǎo)出的矢量圖文件，比如我這里的PDF文件。

然后通過(guò) 文件/置入 導(dǎo)入截圖，方法如下。

適當(dāng)調(diào)整下截圖的大小，可以看清物種名稱(chēng)即可，效果如下。

然后使用吸管工具，吸取截圖中的正方形的顏色，并新建色板，方法如下，更詳細(xì)的方法可參考《如何“偷走”大牛文章漂亮的配色？》一文，這里不再贅述。

3.繪制分組圖例

將不同的分組顏色都保存成色板之后就可以繪制圖例了。

這里的網(wǎng)絡(luò)圖的形狀只有圓形，所以使用橢圓工具加文字工具就可以輕松完成圖例繪制。按下Shift鍵不放，使用橢圓工具繪制正圓，先后松開(kāi)鼠標(biāo)和Shift鍵完成繪制，單擊一下第一個(gè)色板（粉紫色）為原形填充顏色。

然后使用文字工具在圓形右側(cè)單擊一下，添加對(duì)應(yīng)的物種名稱(chēng)，比如這里的“Proteobacteria”，調(diào)整字體的大小和樣式，接著“Ctrl+G”將圓形和文字組合起來(lái)。按住Alt鍵，使用“小黑工具”（選擇工具）向右拖動(dòng)組合圖形，再?gòu)?fù)制出3份如下圖。

框選4個(gè)組合圖形，對(duì)這4組圖形進(jìn)行頂對(duì)齊和水平均勻分布，如下圖。

然后，按住Alt鍵使用“小黑工具”（選擇工具）向下拖動(dòng)組合圖形，再?gòu)?fù)制出1份，得到8個(gè)組合圖形。

使用小黑工具多次雙擊（進(jìn)入圖層隔離模式，雙擊空白區(qū)域退出）組合圖形中的圓形，單擊色板可更改填充顏色；同樣，也可以使用文字工具修改文字，最后使用圓角矩形工具添加外框，這樣圖例就添加好啦！

最終，通過(guò) 文件/存儲(chǔ) 保存PDF文件即可，當(dāng)然也可以導(dǎo)出成其他格式的圖片。

當(dāng)然，如果你還是不懂，可以在os云平臺(tái)上免費(fèi)觀看詳細(xì)課教程~

鏈接：http://192.168.123.224:82/class/Home/Index/series?id=60

有問(wèn)題歡迎評(píng)論區(qū)留言~~

參考文獻(xiàn)
Barberán, Albert, Bates S T , Casamayor E O , et al. Using network analysis to explore co-occurrence patterns in soil microbial communities[J]. Isme Journal, 2012, 6(2):343-351.

總結(jié)

以上是生活随笔為你收集整理的cad2008加载 et拓展工具_生物信息工具 | 如何为网络图添加漂亮的图例？的全部?jī)?nèi)容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。

如果覺(jué)得生活随笔網(wǎng)站內(nèi)容還不錯(cuò)，歡迎將生活随笔推薦給好友。