计算机科学在生物信息中的应用,生物信息学在基因组学中的应用
生物信息學在基因組學中的應用
隨著計算機科學、物理學、數(shù)學等與生命科學的相互滲透和交叉,生物信息學愈來愈顯示出其重
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生物信息學是隨著基因組測序數(shù)據(jù)迅猛增加而產生的一門新興學科。人類基因組計劃的順利完成和新一代測序技術的發(fā)展推...
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毒理基因組學主要在基因組水平上研究機體對環(huán)境因子的應答反應,了解基因和環(huán)境交互作用在疾病發(fā)生中的作用。生物信息學...
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生物信息學已成為整個生命科學發(fā)展的重要組成部分,是生命科學研究的前沿領域。作...
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生物信息學(Bioinformatics)是將生物學與計算機科學、數(shù)學等相結合而形成的新興學科。近年來,分子生物學的進步帶動了生物信息學的發(fā)展,并將其應用到藥用植物領域,為中藥研究提供了新的研究手段。本研究將生物信息學應用到藥用植物基因組、后基因組和分子鑒定研究,對其中的關鍵生物信息技術進行了開發(fā)、比較和分析。基因組是對藥用植物進行系統(tǒng)的生物學研究的基礎。本研究對藥用植物基因組中的生物信息學技術和算法進行了研究。在基因組組裝方面,基于重疊圖的組裝策略構建了基因組組裝流程,并使用物理圖譜進行組裝結果驗證和優(yōu)化,以紫芝為例,構建得到48.9Mb的紫芝基因組,共12條染色體序列。在基因預測方面,使用基于隱馬爾可夫模型的從頭預測和基于證據(jù)的預測方法相結合的方式,提高了基因預測的準確性。在基因功能注釋方面,使用Smith-Waterman算法和隱馬爾可夫模型相結合的方法構建了基因功能注釋流程,可搜索Nt、Nr、Swissprot、COG數(shù)...
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生物信息學是以計算機為工具,對大量的DNA和蛋白質等生物信息進行收集、儲存、檢索和分析的科學,目前已成為自然科學的核心領域之一。結合生物...
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總結
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