2021蛋白组学研究常用数据库汇总整理
蛋白質組學產生于20世紀90年代,是以生物體的全部或部分蛋白為研究對象,研究一個生物、一個細胞(組織)或基因組的蛋白質的變化規律的一門學科。
蛋白質組學能夠在整體水平上研究蛋白質的表達、調控的水平和規律,目的是了解蛋白質間的聯系與相互作用,為生命活動規律提供理論和物質基礎,為人類的健康帶來理論依據和解決方案。
由于平臺規定發不了鏈接,數據庫地址詳見文末。
1.UniProt(The Universal Protein Resource)
簡介:提供詳細的蛋白質序列、功能信息,如蛋白質功能描述、結構域結構、轉錄后修飾等,同時提供其他數據庫,包括序列數據庫、三維結構數據庫、2-D凝聚電泳數據庫、蛋白質家族數據庫的相應鏈接
2.PIR(Protein Information Resource)
簡介:與90多個生物數據庫(蛋白家族、蛋白質功能、蛋白質網絡、蛋白質互作、基因組等數據庫)存在著交叉應用,可提供及時的、高質量、最廣泛的注釋
3.BRENDA(Enzyme database)
簡介:酶數據庫,提供酶的分類、命名法、生化反應、專一性、結構、細胞定位、提取方法、文獻、應用與改造及相關疾病的數據
4.CORUM(Collection of experimentally verified mammalian protein complexes)
簡介:哺乳動物蛋白復合物數據庫,提供的數據包括蛋白復合物名稱、亞基、功能、相關文獻等
5.CyBase(Cyclic protein database)
簡介:環狀蛋白數據庫,提供環狀蛋白的序列、結構等數據,提供環化蛋白預測服務
6.OKCAM
簡介:人體細胞粘附分子數據庫
7.GELBANK
簡介:提供全基因組的二維凝膠電泳圖譜,搜集了已知基因組信息生物的蛋白質組二維凝膠電泳圖。可通過描述相對分子質量、等電點和蛋白質序列信息進行快速檢索
8.SWISS-2DPAGE
簡介:提供人類、小鼠、大腸桿菌、釀酒酵母、盤基網柄菌的2D-PAGE參考圖
9.SysPIMP(Systematical Platform for Identifying Mutated Proteins)
簡介:通過質譜技術建立的蛋白質突變數據庫
10.Sys-BodyFluid
簡介:人體體液蛋白組研究數據庫
11.DB-PABP
簡介:聚陰離子結合蛋白數據庫
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總結
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