LncRNADisease database数据库使用方法
LncRNADisese database
數據庫概覽
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進入LncRNADisease database主頁(見文末),該數據庫收錄來自實驗結果支持的lncRNA與disease關聯數據,以及蛋白、mRNA、miRNA和DNA等不同分子類型與lncRNA相互作用研究結果,包括結合、調控和共表達關系,所有數據均可供瀏覽或下載。
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當前版本總共集成近3000個lncRNA分子與disease關聯數據條目,475個lncRNA交互條目。除外信息查詢功能,該數據庫還可以基于一個新的lncRNA基因組背景來預測其可能的相關疾病,建立新的lncRNA與disease關聯性,目前提供1564個人類lncRNAs對疾病的預測結果。
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主頁History提供既往數據庫更新信息,目前最新版本為2019年1月份更新的LncRNADisease 2.0版本,在Links處點擊鏈接進入,2.0版新增實驗結果支持的circRNA與疾病關聯數據,提供ncRNA、mRNA和miRNA之間調控關系數據,并為每個lncRNA與疾病關聯條目提供置信評分。
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該版本目前涵蓋19166個LncRNAs和823個circRNAs與529種疾病之間,總計205959個LncRNA-disease關聯條目和1004個circRNA-disease關聯條目以及2297個LncRNA和198個circRNA病因學條目,物種包括人、大鼠、小鼠和雞等。
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點擊Browse,預覽該數據庫收錄的lncRNA信息和疾病信息:左側欄lncRNA條目下任選一個點擊進入,第一個表格提供該lncRNA詳細信息,包括名稱,染色體位置,基因組起止位點,DNA鏈,別名,Genbank鏈接,以及Gene序列和RNA序列信息。
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總結
以上是生活随笔為你收集整理的LncRNADisease database数据库使用方法的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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