真核转录组(denovo/resequencing)及案例分析
參考:
轉錄組文章的常規套路
文章解讀:《Science》小麥轉錄組研究文章
轉錄組數據飽和度評估方法
Paper這個東西是多么的誘人,可以畢業,可以評職稱,可以拿績效。
現在的文章都是有套路的,也不能說是水文,但大多是一個模式下的產物,真正有價值的好文其實是少之又少的。
大部分的Paper都是八股文,只需要填詞就好了。
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Transcriptome analysis of leaves, roots and flowers of Panax notoginseng identifies genes involved in ginsenoside and alkaloid biosynthesis - BMC Genomics201516:265 DOI: 10.1186/s12864-015-1477-5
轉錄組測序研究人參的皂苷和生物堿合成的基因
普及詞匯:Transcriptome(轉錄組),Panax notoginseng(三七、田七、人參),ginsenoside (人參皂苷),alkaloid(生物堿)
triterpene saponins(皂苷)、
研究方法及結果:轉錄組分析了三個組織(葉、根、花),組裝后有107,340 unigenes,9,908 unigenes were assigned to 135 KEGG pathways,270 unigenes were identified to be involved in triterpene saponin biosynthesis。
深度剖析:本文做了什么呢?沒有處理,直接取了三種組織的樣品,做轉錄組測序分析,組裝,得到unigenes;然后就是與已知的數據庫(KEGG)比對,搜索出了一大堆的注釋信息,挑出注釋到關鍵代謝通路上的unigenes;最后做一個驗證。
轉載于:https://www.cnblogs.com/leezx/p/6245551.html
總結
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