4 系统的 CPU 使用率很高,但为啥却找不到高 CPU的应用?
??? 上一節講了 CPU 使用率是什么,并通過一個案例教你使用 top、vmstat、pidstat 等工具,排查高 CPU 使用率的進程,然后再使用 perf top 工具,定位應用內部函數的問題。不過就有人留言了,說似乎感覺高 CPU 使用率的問題,還是挺容易排查的。那是不是所有 CPU 使用率高的問題,都可以這么分析呢?我想,你的答案應該是否定的。
??? 回顧前面的內容,我們知道,系統的 CPU 使用率,不僅包括進程用戶態和內核態的運行, 還包括中斷處理、等待 I/O 以及內核線程等。所以,當你發現系統的 CPU 使用率很高的 時候,不一定能找到相對應的高 CPU 使用率的進程。
案例分析
準備
探究系統 CPU 使用率高的情況,所以這次實驗的準備工作,與上節課的準備工作基本相同,差別在于案例所用的 Docker 鏡像不同。
預先安裝 docker、sysstat、perf、ab 等工具,如 yum install docker.io sysstat linux-tools-common apache2-utils ,ab(apache bench)是一個常用的 HTTP 服務性能測試工具,這里同樣用來模擬 Nginx 的客戶端。由于 Nginx 和 PHP 的配置比較麻煩,我把它們打包成了兩個 Docker 鏡像,這樣只需要運行兩個容器,就可以得到模擬環境。
??? 其中一臺用作 Web 服務器,來模擬性能問題;另一臺用作 Web 服務器的客戶端,來給 Web 服務增加壓力請求。使用兩臺虛擬機是為了相互隔離,避免“交叉感染”。
docker run --name nginx -p 10000:80 -itd feisky/nginx:sp docker run --name phpfpm -itd --network container:nginx feisky/php-fpm:sp訪問第一臺機器 [root@bzhl ~]# curl http://23.106.155.240:10000/ It works!測試
??? 我們來測試一下這個 Nginx 服務的性能。在第二個終端運行下面的 ab 命令。要注意,與上次操作不同的是,這次我們需要并發 100 個請求測試 Nginx 性能,總共測試1000 個請求。
[root@bzhl ~]# ab -c 100 -n 1000 http://23.106.155.240:10000/Complete requests: 1000 Failed requests: 0 Total transferred: 172000 bytes HTML transferred: 9000 bytes Requests per second: 112.08 [#/sec] (mean) Time per request: 892.222 [ms] (mean) Time per request: 8.922 [ms] (mean, across all concurrent requests) Transfer rate: 18.83 [Kbytes/sec] received??? 從 ab 的輸出結果我們可以看到,Nginx 能承受的每秒平均請求數,只有 112.08多一點,是不是感覺它的性能有點差呀。那么,到底是哪里出了問題呢?我們再用 top 和 pidstat 來觀察一下。這次,我們在第二個終端,將測試的并發請求數改成 5,同時把請求時長設置為 10 分鐘(-t 600)。這樣,當你在第一個終端使用性能分析工具時, Nginx 的壓力還是繼續的。繼續在第二個終端運行 ab 命令:
??? 然后,我們在第一個終端運行 top 命令,觀察系統的 CPU 使用情況:
top - 11:22:55 up 35 days, 21:36, 1 user, load average: 1.28, 0.52, 0.22 Tasks: 119 total, 6 running, 74 sleeping, 0 stopped, 0 zombie %Cpu0 : 60.4 us, 14.7 sy, 0.0 ni, 24.6 id, 0.0 wa, 0.0 hi, 0.4 si, 0.0 st %Cpu1 : 59.6 us, 15.7 sy, 0.0 ni, 22.3 id, 0.0 wa, 0.0 hi, 2.4 si, 0.0 st KiB Mem : 2057308 total, 152184 free, 366672 used, 1538452 buff/cache KiB Swap: 524284 total, 523760 free, 524 used. 1402364 avail MemPID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND 32020 101 20 0 33104 3692 2276 S 3.7 0.2 0:01.67 nginx 2743 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.7 0.8 0:00.95 php-fpm 2752 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.3 0.8 0:00.96 php-fpm 2755 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.3 0.8 0:00.90 php-fpm 2738 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.0 0.8 0:00.95 php-fpm 2766 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.0 0.8 0:00.91 php-fpm 31726 root 20 0 655612 77988 39920 S 1.3 3.8 0:15.71 dockerd 31970 root 20 0 108756 8400 4504 S 1.3 0.4 0:00.87 containerd-shim10 root 20 0 0 0 0 R 0.3 0.0 0:47.50 rcu_sched 6094 root 20 0 221712 20704 7596 S 0.3 1.0 32:23.52 python1 root 20 0 125520 5220 3828 S 0.0 0.3 1:40.77 systemd??? 觀察 top 輸出的進程列表可以發現,CPU 使用率最高的進程也只不過才3.7%,看起來并不高。然而,再看系統 CPU 使用率( %Cpu )這一行,你會發現,系統的整體 CPU 使用率是比較高的:用戶 CPU 使用率(us)已經到了 60%,系統 CPU 為 15.1%,而空閑 CPU(id)則只有 29%。為什么用戶 CPU 使用率這么高呢?我們再重新分析一下進程列表,看看有沒有可疑進程:
docker-containerd 進程是用來運行容器的,2.7% 的 CPU 使用率看起來正常;
Nginx 和 php-fpm 是運行 Web 服務的,它們會占用一些 CPU 也不意外,并且 2% 的CPU 使用率也不算高;
??? 再往下看,后面的進程呢,只有 0.3% 的 CPU 使用率,看起來不太像會導致用戶 CPU 使用率達到 80%。那就奇怪了,明明用戶 CPU 使用率都 80% 了,可我們挨個分析了一遍進程列表,還是找不到高 CPU 使用率的進程。看來 top 是不管用了,那還有其他工具可以查看進程 CPU 使用情況嗎?不知道你記不記得我們的老朋友 pidstat,它可以用來分析進程的 CPU 使用情況。
[root@doit ~]# pidstat 1 Linux 4.20.0-1.el7.elrepo.x86_64 (doit) 07/14/2019 _x86_64_ (2 CPU)11:41:56 AM UID PID %usr %system %guest %wait %CPU CPU Command 11:41:57 AM 0 16 0.00 0.97 0.00 0.00 0.97 1 ksoftirqd/1 11:41:57 AM 1 7110 0.00 0.97 0.00 3.88 0.97 1 php-fpm 11:41:57 AM 1 7115 0.97 1.94 0.00 4.85 2.91 1 php-fpm 11:41:57 AM 1 7123 0.00 1.94 0.00 2.91 1.94 0 php-fpm 11:41:57 AM 1 7127 0.00 0.97 0.00 2.91 0.97 1 php-fpm 11:41:57 AM 1 7137 0.97 1.94 0.00 4.85 2.91 0 php-fpm 11:41:57 AM 0 24569 0.00 0.97 0.00 0.00 0.97 1 pidstat 11:41:57 AM 1 24780 0.00 2.91 0.00 0.00 2.91 1 php-fpm 11:41:57 AM 0 31726 0.97 0.00 0.00 0.00 0.97 1 dockerd 11:41:57 AM 0 31970 0.00 1.94 0.00 0.00 1.94 0 containerd-shim 11:41:57 AM 101 32020 0.97 1.94 0.00 11.65 2.91 0 nginx[root@doit ~]# uptime 11:42:56 up 35 days, 21:56, 1 user, load average: 2.82, 1.33, 0.81??? 觀察一會兒,你是不是發現,所有進程的 CPU 使用率也都不高啊,最高的 Docker 和Nginx 也只有 4% 和 3%,即使所有進程的 CPU 使用率都加起來,也不過是 21%,離80% 還差得遠呢!后來我發現,會出現這種情況,很可能是因為前面的分析漏了一些關鍵信息。你可以先暫 停一下,自己往上翻,重新操作檢查一遍。或者,我們一起返回去分析 top 的輸出,看看能不能有新發現。現在,我們回到第一個終端,重新運行 top 命令,并觀察一會兒
top - 11:49:53 up 35 days, 22:03, 2 users, load average: 4.12, 3.15, 1.84 Tasks: 128 total, 4 running, 82 sleeping, 0 stopped, 0 zombie %Cpu(s): 49.5 us, 12.6 sy, 0.0 ni, 36.7 id, 0.0 wa, 0.0 hi, 1.2 si, 0.0 st KiB Mem : 2057308 total, 93240 free, 374216 used, 1589852 buff/cache KiB Swap: 524284 total, 523760 free, 524 used. 1389000 avail MemPID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND 32020 101 20 0 33104 3692 2276 S 2.6 0.2 0:21.73 nginx 12098 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.0 0.8 0:06.72 php-fpm 12124 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.0 0.8 0:06.70 php-fpm 31970 root 20 0 108756 8220 4504 S 2.0 0.4 0:13.37 containerd-shim 12075 bin 20 0 336696 16064 8392 S 1.7 0.8 0:06.89 php-fpm 12080 bin 20 0 336696 16064 8392 S 1.7 0.8 0:06.89 php-fpm 12083 bin 20 0 336696 16064 8392 S 1.7 0.8 0:06.66 php-fpm 31726 root 20 0 655612 77920 39920 S 1.0 3.8 0:22.63 dockerd16 root 20 0 0 0 0 S 0.7 0.0 0:14.97 ksoftirqd/1 31383 bin 20 0 0 0 0 R 0.3 0.0 0:00.01 stress??? 這次從頭開始看 top 的每行輸出,咦?Tasks 這一行看起來有點奇怪,就緒隊列中居然有6 個 Running 狀態的進程(6 running),是不是有點多呢?回想一下 ab 測試的參數,并發請求數是 5。再看進程列表里, php-fpm 的數量也是 5, 再加上 Nginx,好像同時有 6 個進程也并不奇怪。但真的是這樣嗎?
??? 再仔細看進程列表,這次主要看 Running(R) 狀態的進程。你有沒有發現, Nginx 和所有的 php-fpm 都處于 Sleep(S)狀態,而真正處于 Running(R)狀態的,卻是幾個stress 進程。這幾個 stress 進程就比較奇怪了,需要我們做進一步的分析。
我們還是使用 pidstat 來分析這幾個進程,并且使用 -p 選項指定進程的 PID。首先,從上面 top 的結果中,找到這幾個進程的 PID。比如,先隨便找一個 24344,然后用 pidstat 命令看一下它的 CPU 使用情況:
[root@doit ~]# pidstat -p 31383 Linux 4.20.0-1.el7.elrepo.x86_64 (doit) 07/14/2019 _x86_64_ (2 CPU) 11:50:40 AM UID PID %usr %system %guest %wait %CPU CPU Command 奇怪,居然沒有任何輸出。難道是 pidstat 命令出問題了嗎?之前我說過,在懷疑性能工具出問題前,最好還是先用其他工具交叉確認一下。那用什么工具呢? ps 應該是最簡單易用的。我們在終端里運行下面的命令,看看 24344 進程的狀態:[root@doit ~]# ps aux |grep 31383 root 483 0.0 0.1 112720 2344 pts/1 S+ 11:51 0:00 grep --color=auto 31383還是沒有輸出。現在終于發現問題,原來這個進程已經不存在了,所以 pidstat 就沒有任何輸出。既然進程都沒了,那性能問題應該也跟著沒了吧。我們再用? top? 命令確認一下:
top - 11:53:11 up 35 days, 22:06, 2 users, load average: 2.46, 2.27, 1.71 Tasks: 126 total, 6 running, 75 sleeping, 0 stopped, 2 zombie %Cpu(s): 53.8 us, 13.9 sy, 0.0 ni, 31.2 id, 0.0 wa, 0.0 hi, 1.0 si, 0.0 st KiB Mem : 2057308 total, 125672 free, 353916 used, 1577720 buff/cache KiB Swap: 524284 total, 523760 free, 524 used. 1412436 avail MemPID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND 32020 101 20 0 33104 3692 2276 R 2.7 0.2 0:23.15 nginx489 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.3 0.8 0:00.94 php-fpm484 bin 20 0 336696 16064 8392 S 2.0 0.8 0:00.88 php-fpm502 bin 20 0 336696 16064 8392 R 2.0 0.8 0:00.91 php-fpm500 bin 20 0 336696 16064 8392 S 1.7 0.8 0:00.88 php-fpm511 bin 20 0 336696 16064 8392 R 1.7 0.8 0:00.86 php-fpm 31970 root 20 0 108756 8340 4504 S 1.7 0.4 0:14.18 containerd-shim 31726 root 20 0 655612 77920 39920 S 1.0 3.8 0:23.15 dockerd10 root 20 0 0 0 0 I 0.3 0.0 0:49.25 rcu_sched 11768 bin 20 0 8188 1624 540 R 0.3 0.1 0:00.01 stress好像又錯了。結果還跟原來一樣,用戶 CPU 使用率還是高達 80.9%,系統 CPU 接近15%,而空閑 CPU 只有 2.8%,Running 狀態的進程有 Nginx、stress 等。
可是,剛剛我們看到 stress 進程不存在了,怎么現在還在運行呢?再細看一下 top 的輸出,原來,這次 stress 進程的 PID 跟前面不一樣了,原來的 PID 24344 不見了,現在的是 6779。
進程的 PID 在變,這說明什么呢?在我看來,要么是這些進程在不停地重啟,要么就是全新的進程,這無非也就兩個原因:
第一個原因,進程在不停地崩潰重啟,比如因為段錯誤、配置錯誤等等,這時,進程在退出后可能又被監控系統自動重啟了。
第二個原因,這些進程都是短時進程,也就是在其他應用內部通過 exec 調用的外面命令。這些命令一般都只運行很短的時間就會結束,你很難用 top 這種間隔時間比較長的工具發現(上面的案例,我們碰巧發現了)。
至于 stress,我們前面提到過,它是一個常用的壓力測試工具。它的 PID 在不斷變化中, 看起來像是被其他進程調用的短時進程。要想繼續分析下去,還得找到它們的父進程。
要怎么查找一個進程的父進程呢?沒錯,用 pstree 就可以用樹狀形式顯示所有進程之間的關系:
[root@doit ~]# pstree |grep stress| | | |-php-fpm---sh---stress---stress從這里可以看到,stress 是被 php-fpm 調用的子進程,并且進程數量不止一個(這里是3 個)。找到父進程后,我們能進入 app 的內部分析了。
首先,當然應該去看看它的源碼。運行下面的命令,把案例應用的源碼拷貝到 app 目錄, 然后再執行 grep 查找是不是有代碼再調用 stress 命令:
[root@doit ~]# docker cp phpfpm:/app . grep 查找看看是不是有代碼在調用 stress 命令[root@doit ~]# grep stress -r app app/index.php:// fake I/O with stress (via write()/unlink()). app/index.php:$result = exec("/usr/local/bin/stress -t 1 -d 1 2>&1", $output, $status);找到了,果然是 app/index.php 文件中直接調用了 stress 命令。再來看看 app/index.php 的源代碼:
[root@doit ~]# cat app/index.php <?php // fake I/O with stress (via write()/unlink()). $result = exec("/usr/local/bin/stress -t 1 -d 1 2>&1", $output, $status); if (isset($_GET["verbose"]) && $_GET["verbose"]==1 && $status != 0) {echo "Server internal error: ";print_r($output); } else {echo "It works!"; }可以看到,源碼里對每個請求都會調用一個 stress 命令,模擬 I/O 壓力。從注釋上看, stress 會通過 write() 和 unlink() 對 I/O 進程進行壓測,看來,這應該就是系統 CPU 使用率升高的根源了。
不過,stress 模擬的是 I/O 壓力,而之前在 top 的輸出中看到的,卻一直是用戶 CPU 和系統 CPU 升高,并沒見到 iowait 升高。這又是怎么回事呢?stress 到底是不是 CPU 使
用率升高的原因呢?
我們還得繼續往下走。從代碼中可以看到,給請求加入 verbose=1 參數后,就可以查看stress 的輸出。你先試試看,在第二個終端運行:
[root@bzhl ~]# curl http://23.106.155.240:10000?verbose=1 Server internal error: Array ([0] => stress: info: [9490] dispatching hogs: 0 cpu, 0 io, 0 vm, 1 hdd[1] => stress: FAIL: [9491] (563) mkstemp failed: Permission denied[2] => stress: FAIL: [9490] (394) <-- worker 9491 returned error 1[3] => stress: WARN: [9490] (396) now reaping child worker processes[4] => stress: FAIL: [9490] (400) kill error: No such process[5] => stress: FAIL: [9490] (451) failed run completed in 0s )看錯誤消息 mkstemp failed: Permission denied ,以及 failed run completed in 0s。原來 stress 命令并沒有成功,它因為權限問題失敗退出了。看來,我們發現了一個 PHP 調用外部 stress 命令的 bug:沒有權限創建臨時文件。
從這里我們可以猜測,正是由于權限錯誤,大量的 stress 進程在啟動時初始化失敗,進而導致用戶 CPU 使用率的升高。
分析出問題來源,下一步是不是就要開始優化了呢?當然不是!既然只是猜測,那就需要 再確認一下,這個猜測到底對不對,是不是真的有大量的 stress 進程。該用什么工具或指標呢?
我們前面已經用了 top、pidstat、pstree 等工具,沒有發現大量的 stress 進程。那么, 還有什么其他的工具可以用嗎?
還記得上一期提到的 perf 嗎?它可以用來分析 CPU 性能事件,用在這里就很合適。依舊在第一個終端中運行 perf record -g 命令 ,并等待一會兒(比如 15 秒)后按 Ctrl+C 退出。然后再運行 perf report 查看報告:
[root@doit ~]# perf record -g ^C[ perf record: Woken up 13 times to write data ] [ perf record: Captured and wrote 3.548 MB perf.data (25041 samples) ][root@doit ~]# perf report你看,stress 占了所有 CPU 時鐘事件的 77%,而 stress 調用調用棧中比例最高的,是隨機數生成函數 random(),看來它的確就是 CPU 使用率升高的元兇了。隨后的優化就很簡單了,只要修復權限問題,并減少或刪除 stress 的調用,就可以減輕系統的 CPU 壓力。
當然,實際生產環境中的問題一般都要比這個案例復雜,在你找到觸發瓶頸的命令行后, 卻可能發現,這個外部命令的調用過程是應用核心邏輯的一部分,并不能輕易減少或者刪除。這時,你就得繼續排查,為什么被調用的命令,會導致 CPU 使用率升高或 I/O 升高等問題。這些復雜場景的案例,我會在后面的綜合實戰里詳細分析。最后,在案例結束時,不要忘了清理環境,執行下面的 Docker 命令,停止案例中用到的Nginx 進程:
?docker rm -f nginx phpfpm?
execsnoop
在這個案例中,我們使用了 top、pidstat、pstree 等工具分析了系統 CPU 使用率高的問題,并發現 CPU 升高是短時進程 stress 導致的,但是整個分析過程還是比較復雜的。對于這類問題,有沒有更好的方法監控呢?
execsnoop 就是一個專為短時進程設計的工具。它通過 ftrace 實時監控進程的 exec() 行為,并輸出短時進程的基本信息,包括進程 PID、父進程 PID、命令行參數以及執行的結果。
比如,用 execsnoop 監控上述案例,就可以直接得到 stress 進程的父進程 PID 以及它的命令行參數,并可以發現大量的 stress 進程在不停啟動:
git clone --depth 1 https://github.com/brendangregg/perf-tools [root@doit perf-tools]# ./execsnoopexecsnoop 所用的 ftrace 是一種常用的動態追蹤技術,一般用于分析 Linux 內核的運行時行為,后面課程我也會詳細介紹并帶你使用。
小結
碰到常規問題無法解釋的 CPU 使用率情況時,首先要想到有可能是短時應用導致的問題, 比如有可能是下面這兩種情況。
第一,應用里直接調用了其他二進制程序,這些程序通常運行時間比較短,通過 top 等工具也不容易發現。
第二,應用本身在不停地崩潰重啟,而啟動過程的資源初始化,很可能會占用相當多的CPU。
對于這類進程,我們可以用 pstree 或者 execsnoop 找到它們的父進程,再從父進程所在的應用入手,排查問題的根源。
perf record -ag -- sleep 2;perf report
總結
以上是生活随笔為你收集整理的4 系统的 CPU 使用率很高,但为啥却找不到高 CPU的应用?的全部內容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。
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