每日一题:DNA序列
生活随笔
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每日一题:DNA序列
小編覺得挺不錯(cuò)的,現(xiàn)在分享給大家,幫大家做個(gè)參考.
一、題目描述
一個(gè)DNA序列由A/C/G/T四個(gè)字母的排列組合組成。G和C的比例(定義為GC-Ratio)是序列中G和C兩個(gè)字母的總的出現(xiàn)次數(shù)除以總的字母數(shù)目(也就是序列長(zhǎng)度)。在基因工程中,這個(gè)比例非常重要。因?yàn)楦叩腉C-Ratio可能是基因的起始點(diǎn)。
給定一個(gè)很長(zhǎng)的DNA序列,以及要求的最小子序列長(zhǎng)度,研究人員經(jīng)常會(huì)需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
輸入描述:輸入一個(gè)string型基因序列,和int型子串的長(zhǎng)度 n
輸出描述:找出GC比例最高的子串,如果有多個(gè)輸出第一個(gè)的子串
二、思路分析
從頭遍歷字符串,下標(biāo) i 位置到 (i + n) 為一組,計(jì)算出每一組中包含 “G” 和 “C” 的個(gè)數(shù),找出個(gè)數(shù)最多的一組,將這一組的第一個(gè)字符下標(biāo)保存下來(lái),此位置到該位置 + n 處表示的字符串就是 GC-Ratio 最高的子序列。
三,代碼
import java.util.*; public class Main {public static void main(String[] args) {Scanner input = new Scanner(System.in);while (input.hasNext()) {String str = input.next();int n = input.nextInt();int max = 0;int index = 0;for (int i = 0; i <= str.length()-n; i++) {int count = 0;for (int j = i; j < i+n; j++) {if (str.charAt(j)=='G'||str.charAt(j)=='C')count++;}if (count > max){index = i;max = count;}}System.out.println(str.substring(index, index+n));}} }總結(jié)
以上是生活随笔為你收集整理的每日一题:DNA序列的全部?jī)?nèi)容,希望文章能夠幫你解決所遇到的問(wèn)題。
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