upsetR是除了韋恩圖之外另一種集合可視化的方法。一般集合不超過5個的時候，可視化效果還是不錯的，但是集合超過五個時，你就很難從圖中解讀出想要的信息了。

這是我們可以使用upsetR包來進行處理。

upset圖要結合柱子和點一起來看。

首先我們導入的數據為list <- list(Heart=rownames(subset(d1, group=='Network')), Muscle=rownames(subset(d2, group=='Network')), Lung=rownames(subset(d3, group=='Network'))) 里面是不同器官的基因，而這三個器官的基因之中會有交集。

第一個柱子，點在heart那行，表明該柱子表示只屬于heart的基因數量。

?所以是1107

第二個柱子，點在muscle那行，表明該柱子表示只屬于muscle的基因數量。

所以是483

第三個柱子，點在muscle和heart兩行，表明該柱子表示muscle和heart交集中的基因數量（但不包括muscle，heart，lung三個交集中的基因）。

所以是399

第六個柱子，點在muscle和heart，lung三行，表明該柱子表示muscle和heart，lung交集中的基因數量。

所以是中間的交集105個

即：點在哪些集合的那行，上面的柱子就表示兩幾個集合的交集。（只有那幾個交集的部分）

總結

以上是生活随笔為你收集整理的upset图形如何理解的全部內容，希望文章能夠幫你解決所遇到的問題。

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